秦巴山区漆树nrDNAITS和cpDNA序列分子进化特点的分析
2017-11-11柏国清李为民李思锋
柏国清 李为民 陈 昊 黎 斌 李思锋
(陕西省植物研究所陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心,西安 710061)
秦巴山区漆树nrDNAITS和cpDNA序列分子进化特点的分析
柏国清 李为民 陈 昊 黎 斌 李思锋*
(陕西省植物研究所陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心,西安 710061)
应用PCR产物直接测序法分析漆树种群nrDNA(核糖体DNA)ITS序列和cpDNA序列(matK、rbcL、psbA-trnH)的碱基差异,初步研究两套植物基因组的变异速率。结果表明:nrDNA ITS序列共有518 bp,有变异位点15处,变异位点百分率为2.9%,(G+C)含量为61.8%。cpDNA序列合并后长度1 907 bp,有变异位点20处,变异位点百分率为1.05%,(G+C)含量为36.1%。通过对ITS序列核糖型(Ribotype)和叶绿体序列单倍型(Haploype)进行分析发现,秦巴山区漆树区域性分布明显,不同区域拥有自己独特的单倍型,漆树居群历史近期没有扩张。nrDNA ITS序列较叶绿体序列进化较快,变异速率较快。nrDNA ITS序列及叶绿体matK、psbA-trnH适合漆树的亲缘地理学研究。
漆树;ITS序列;叶绿体DNA序列
漆树(Toxicodendronvernicifluum(stokes)F.A.Barkley)隶属于漆树科(Anacardiaceae)漆树属(Toxicodendron)植物,落叶乔木。主要分布在我国陕西、重庆、甘肃、湖北、广西、贵州、四川和云南等地区[1]。属亚热带植物区系,新生代第三纪古老孑遗树种[2],漆树的经济价值很高,不但能满足人类的物质生活需求,也能满足人们的审美情趣。漆树皮层采割的次生代谢物——生漆,是一种优质的天然涂料;漆树木材材质软硬适中,花纹美观,耐腐,耐湿,是建筑、家具、乐器等优质用材;漆树的叶、花、根、皮、果实、干漆都可以入药[3]。经过长期的自然选择和人工驯化栽培,目前我国漆树已经形成众多的漆树品种和类型,具有丰富的漆树种质资源。……
