王懋林 胡尚连* 曹 颍 卢学琴 徐 刚 黄 艳 龙志坚

(1.西南科技大学植物细胞工程实验室，绵阳 621010； 2.四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心，绵阳 621010)

梁山慈竹体细胞突变体No.30的SLAF-seq特异分子标记分析

王懋林1,2胡尚连1,2*曹 颍1,2卢学琴1,2徐 刚1,2黄 艳1,2龙志坚1,2

(1.西南科技大学植物细胞工程实验室，绵阳 621010；2.四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心，绵阳 621010)

梁山慈竹体细胞突变体No.30具有纤维素含量高、木质素含量高、纤维细胞长度长、纤维细胞长宽比大等特点，但由于梁山慈竹主要进行无性繁殖，不易获得纯合植株，突变体No.30的分子水平鉴定一直无法进行，严重阻碍了该突变体的推广利用。对梁山慈竹体细胞突变体No.30进行特异分子标记分析，并初步确定其性状变异来源。本研究利用SLAF-seq技术分别对突变体No.30以及同地区野生型梁山慈竹群体(CK)的基因组进行了简化基因组测序。经过了测序、建库、多态位点开发、特异多态性位点筛选等过程，最后对特异多态性位点筛选结果进行注释分析。结果发现突变体No.30的GC含量、纯合InDel数低于野生型梁山慈竹，而检测到的InDel总数以及杂合InDel数却高于野生群体。对SLAF-seq得到的InDel、SNP位点进行特异性筛选，获得了突变体No.30中稳定存在的特异InDel/SNP标签，包括特异C-T转换9381个、特异A-G转换9472个、特异InDel 329个。通过对这些特异SLAF标签进行注释，发现有6个特异SNP标签和1个特异InDel与纤维素合成相关，3个特异SNP标签与木质素合成相关，以及4个特异SNP标签和1个特异InDel与纤维细胞形态建成有关。……