成骨不全环状RNA生物信息学分析
2017-08-06马翔鲁艳芹王延宙刘军龙苏学利张遥左清利任秀智韩金祥
马翔 鲁艳芹 王延宙 刘军龙 苏学利 张遥 左清利 任秀智 韩金祥*
1. 济南大学-山东省医学科学院医学与生命科学学院,山东 济南 250022 2. 山东省医药生物技术研究中心,山东省医学科学院,山东 济南 250062 3. 山东省立医院,山东 济南 250021 4. 天津市武清区人民医院,天津 301700
环状RNA作为新型的非编码RNA分子稳定性高,存在范围广泛,具有高表达性、组织特异性以及良好的物种保守性。CircRNAs具有重要的调控功能,能作为miRNAs海绵功能分子[1]。在斑马鱼实验中,胚胎中超高表达CDR1as 可导致斑马鱼脑中脑体积减少,将人/鼠的CDR1as注射到斑马鱼中会出现与miR-7敲除相似的表型,CDR1as的表达水平与miR-7靶基因表达水平表现出一致性,表明CDR1as是miR-7的环状抑制剂[2-3]。研究发现circRNAs与阿兹海默症、动脉粥样硬化、糖尿病、癌症等疾病的发生有关[4-8]。最新研究发现在一些癌症(肺癌、胃癌)等疾病中对于筛选出差异性表达的circRNAs,通过结合临床信息以及医学统计学检验,认为所筛选出的circRNAs具有作为疾病诊断潜在标记物的可能性[9-11]。同时又有研究发现相比于其他组织血液中很多circRNAs分子表达稳定性更高[12],circRNAs所发挥的生物学功能和作为疾病诊断标志物在临床治疗上的潜力是巨大的。
成骨不全(osteogenesisImperfecta,OI)是一种通过遗传或者基因突变而产生的先天性骨骼发育障碍结蹄组织疾病[13-15]。通过对116种相关的miRNAs进行检测发现 miR-21与miR-26a等11 种miRNAs在成骨不全血清中存在差异表达[16-18]。本文拟通过生物信息学预测,分析与成骨不全差异性表达miRNAs相互作用的circRNAs,同时探讨circRNA-miRNA-靶基因之间的相互作用。……
