武光东，邱 彬，王婷婷，刘云波，雍伟东

(中国医学科学院医学实验动物研究所,北京协和医学院比较医学中心,卫生部人类疾病比较医学重点实验室,国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室，北京 100021)

Fkbp51基因敲除小鼠心脏与肝脏RNA表达谱系的分析比较

武光东，邱 彬，王婷婷，刘云波*，雍伟东*

(中国医学科学院医学实验动物研究所,北京协和医学院比较医学中心,卫生部人类疾病比较医学重点实验室,国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室，北京 100021)

目的 通过分析野生型小鼠(WT)和Fkbp51基因敲除(KO)小鼠心脏与肝RNA表达谱系之间的差异，研究Fkbp51基因在心脏和肝组织代谢通路中的作用。方法 利用第二代高通量基因测序技术，对Fkbp51 KO和WT小鼠的心脏和肝进行mRNA表达谱测序，将心脏测序的数据结果用DEGseq进行差异分析，肝脏组织测序结果用BRB-Array Tools进行分析，分别筛选出小鼠心脏和肝的差异基因，利用在线工具DAVID对差异基因进行GO本体分析和KEGG通路分析，利用BioinfoGP数据库的Venn工具分析两种组织的共差异基因，利用STRING数据库对蛋白质的互作网络进行分析。结果 (1)Fkbp51的缺失导致心脏中血管平滑肌收缩、趋化因子信号、视黄醇信号和MAPK信号等相关通路的mRNA表达发生改变；(2)Fkbp51的缺失导致肝组织中胆固醇合成及代谢、脂类代谢以及氧化还原等相关基因和通路的变化；(3)在心脏和肝组织中，Fkbp51缺失造成了4个共差异基因，其中Rnaset2b、Hmga1和Fkbp51下调，而Cyp2b10在心脏组织中下调，在肝组织中上调。这些蛋白均可与HSP90蛋白相互作用，参与心脏和肝组织中的代谢。……