大头典竹ISSR反应体系建立与优化
2017-07-21瞿印权徐雯沈露何天友魏建文荣
瞿印权 徐雯 沈露 何天友++魏建文 荣俊冬 郑郁善
摘要:以大头典竹叶片为材料,采用单因素分析法和正交设计直观分析法,对影响PCR扩增效果的Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶、引物、模板DNA含量这5个PCR反应体系主要成分以及退火温度和循环次数进行筛选。通过研究建立了适合大头典竹的ISSR-PCR反应体系:20 μL反应液中含2.5 mmol/L Mg2+,0.25 mmol/L dNTPs,1.25 U TaqDNA聚合酶,0.6 μmol/L引物,10 ng模板DNA,2 μL 10×Buffer,10.55 μL ddH2O。相应反应程序为94 ℃预变性 5 min;94 ℃ 变性45 s,54.5 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,35个循环;72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。应用建立的优化反应体系成功地筛选出16条多态性较高的引物,表明该体系具有较高稳定性、重现性、适用性,可较好地应用于大头典竹不同地理种源间的遗传多样性研究。
关键词:大头典竹;ISSR;反应体系;优化
中图分类号: S795.901文献标志码: A
文章编号:1002-1302(2017)10-0034-06
地球上的竹类植物共有88属1 400多种,主要分布在亚太区、美洲区、非洲区[1]。中国竹类主要分布于长江中下游,其中以福建、浙江、江西、湖南4省最多,占全国竹林面积的60.7%[2]。大头典竹[Dendrocalamopsis beecheyana var. pubescens (P. F. Li) Keng f.]属于竹亚科(Bambusoideae)绿竹属[Dendrocalamopsis (Chia et H. L. Fung) Keng f.]的丛生竹,别称新竹、荣竹,具有繁殖生长快、根系发达、适应性广等特点。目前,在我国关于大头典竹在分子生物方面的研究较少。[JP]
近年来,随着现代分子生物学的快速发展,分子标记技术被广泛应用于遗传多样性以及指纹图谱构建的研究[3-5]。目前应用最为广泛的分子标记技术主要有RFLP、RAPD、AFLP、ISSR、SRAP等[6]。其中SSR序列广泛分布在高等生物的染色体上,因此利用该简单重复序列标记(inter simple sequence repeat,ISSR)技术可以获得较多的分子标记。ISSR的引物长度较RAPD引物长,因此ISSR具有重现性的特点,可以获得较可靠的遗传多样性信息,有利于植物种间及种内的鉴别[7]。……
