提取枸杞棉蚜基因组DNA的9种方法比较
2017-07-21李琳琳严林金生英谢久祥温小成
李琳琳 严林 金生英 谢久祥 温小成
摘要:为探讨适合枸杞棉蚜基因组DNA提取的方法,采用9种方法提取枸杞棉蚜基因组DNA,并对每种方法提取的DNA样本质量进行综合比较分析。结果表明,改进十二烷基硫酸钠(SDS)法、优化KAc法、STE精提法、Chelex粗提法、十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、盐析法均可从枸杞棉蚜中提取总DNA,浓度高且所制备出的DNA均可成功应用于mtDNA CO[QX(Y15]Ⅰ[QX)]基因扩增。STE粗提法、Chelex精提法、饱和NaCl法Ⅱ提取的枸杞棉蚜基因组DNA质量低,不能满足分析要求。改进SDS法及STE精提法所制备的DNA质量较佳、产量较高、实用性强,是值得推广应用的枸杞棉蚜基因组DNA提取方法。盐析法提取DNA,试剂成本低、毒性小,是一种安全有效的枸杞棉蚜基因组DNA提取方法。Chelex粗提法是一种快速的枸杞棉蚜基因组DNA提取方法。
关键词:枸杞;棉蚜;基因组DNA;提取方法
中图分类号: S435.671文献标志码: A
文章编号:1002-1302(2017)10-0030-04
枸杞棉蚜(Aphis gossypii Glover)属同翅目(Hompotera)蚜科(Aphididae)蚜属(Aphis),是我国西北地区栽培枸杞(Licium barbarum L.)分布地的主要害虫,短期内可暴发成灾,引起枸杞果产量和品质严重下降[1]。棉蚜具有明显的生物型[2-3],如棉花型和黄瓜型[4-5],而枸杞棉蚜属于何种生物型亟待验证。确定昆虫的生物型,不仅需要采用传统的生物学特征和生态学参数比较[4,6-7],而且需要分子遗传学数据佐证[2,7-8]。
单头枸杞棉蚜基因组DNA提取是开展枸杞棉蚜分子遗传学研究的前提与基础[9]。由于枸杞棉蚜体型微小,体表有外骨骼,其DNA提取有一定难度。Black等通过十二烷基硫酸钠(SDS)方法提取蚜虫基因组DNA,并通过随机扩增多态性DNA-PCR(RAPD-PCR)检测蚜虫多态性[10];……
