赵志丹，刘建华，钟白云，王恝歆，谢婷彦，张秋焕，冯斯斯，邓辉

(中南大学湘雅医院检验科，长沙 410008)

·研究生园地·

结肠癌淋巴结转移基因谱表达差异分析

赵志丹，刘建华，钟白云，王恝歆，谢婷彦，张秋焕，冯斯斯，邓辉

(中南大学湘雅医院检验科，长沙 410008)

目的 探讨人结肠癌细胞系SW480、SW620基因谱的表达差异。方法 针对NCBI的GEO数据库中编号为GDS756的基因芯片表达数据，用GSEA软件进行基因集富集分析及领头亚群分析，利用FunRich分析软件针对SW480、SW620细胞领头亚群基因进行验证性功能注释，STRING在线分析系统对显著性富集基因集领头亚群基因进行生物网络分析，获得SW480、SW620细胞中心节点基因，并将中心节点基因与高重叠领头亚群基因进行联合分析，以获得参与多功能的中心节点基因。结果 GSEA软件分析筛选出SW480细胞显著性富集基因集12个，领头亚群基因491个，高重叠基因7个；SW620细胞显著性富集基因集80个，领头亚群基因870个，高重叠基因6个。对显著性富集基因集领头亚群基因进行生物网络分析筛选出SW480、SW620细胞相关中心基因数目分别为5个及8个；结合GSEA及生物网络分析结果，获得SW620细胞2个参与多功能调控的核心基因TOP2A、CDK1。结论 遗传背景相同的结肠癌SW620细胞与SW480细胞具有不同的基因功能分布特点，SW620细胞多功能中心节点基因TOP2A、CDK1与结肠癌发展相关信号通路高度相关。

SW480；SW620；基因表达谱；基因集富集分析；生物网络

结肠癌的淋巴结转移是患者5年生存率降低的重要原因[1]。目前认为，结肠癌淋巴结转移是一个多基因共同作用的过程，但其具体机制仍未明确。……