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大肠癌组织与癌旁正常组织基因差异表达图谱及信号通路研究

2017-06-05洪朝金卢丽琴郭勇钦志泉

浙江医学 2017年9期
关键词:差异信号检测

洪朝金 卢丽琴 郭勇 钦志泉

大肠癌组织与癌旁正常组织基因差异表达图谱及信号通路研究

洪朝金 卢丽琴 郭勇 钦志泉

目的 筛查人大肠癌肿瘤组织与相应癌旁正常组织差异表达基因。方法 应用NimbleGen基因芯片检测4例大肠癌肿瘤组织及相应癌旁正常组织基因表达谱,并以RT-PCR技术对部分基因芯片检测结果进行验证,利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果 大肠癌肿瘤组织和癌旁正常组织差异表达基因共5 042条,其中表达水平上调3 399条,下调1 643条,这些基因涉及多个信号通路。结论 本研究结果可为寻找大肠癌分子标记物和探索大肠癌发生的分子机制提供实验依据。

大肠癌 基因芯片 基因表达谱 生物信息学

大肠癌是人类高发恶性肿瘤之一,近年来其发病率和死亡率在我国呈上升趋势,患者趋于年轻化,因此,研究其发病机制显得尤为重要。本研究采用基因芯片技术检测大肠癌肿瘤组织与癌旁正常组织的基因表达差异,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析,探讨大肠癌的发病机制,寻找大肠癌分子标记物和探索大肠癌发生的分子机制提供实验依据。

1 材料和方法

1.1 材料 选取2011年8至10月在浙江省人民医院手术治疗的4例大肠癌患者的组织标本。术前均经肠镜检查明确诊断并经术后病理检查证实,均为中分化结肠腺癌,其中,48岁男性患者为乙状结肠腺癌(pT4aN1M0/ⅢB期),62岁女性患者为乙状结肠腺癌(pT3N2aM0/ⅢB期),62岁男性患者为乙状结肠……

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