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土壤DNA的提取方法比较研究

2017-04-21刘燕刘娟娟吴晴晴

科技资讯 2016年34期
关键词:提取

刘燕++刘娟娟++吴晴晴

摘 要:PCR扩增检测土壤样品中目标微生物的重要前提之一是获得高质量的微生物基因组总DNA。但由于土壤样品种类繁多、组成也相对复杂,且微生物细胞常紧紧吸附在土壤的颗粒表面,因此从土壤样品中获取无偏好、高质量的微生物总DNA具有较大难度。在保证获得高质量土壤微生物总DNA的前提下,有效地将试剂盒与核酸提取仪相结合,以相对较低的成本获得较高质量的土壤微生物总DNA。

关键词:土壤微生物 DNA 提取

中图分类号:S15 文献标识码:A 文章编号:1672-3791(2016)12(a)-0095-02

現阶段提取土壤样品中总DNA的方法,在微生物生态学不断壮大与发展的过程中逐渐发展了起来。据报道,现阶段从土壤样品中获得高质量DNA的方法主要有间接提取法和直接提取法。一般直接提取的效率相对较高,而间接提取的纯度较高。提取土壤样品中总DNA没有通用的唯一的标准方法,实际工作中需根据具体实验目的、土壤样品的特点、实验室的条件而定。

1 材料与方法

1.1 主要试剂盒

主要试剂盒:FastDNA SPIN Kit for Soil试剂盒,GENMED土壤DNA分离试剂盒。

1.2 主要仪器

主要仪器:S1000TM Thermal Cycler,微量台式离心机IEC Micro CL17,DYY-2C型电泳仪,凝胶成像系统,FastPrepTM FP120核酸提取仪,Mini-BeadBeater-16TM核酸提取仪,NanoDrop ND-1000 Spectrophotometer。

1.3 土壤DNA提取方法

方法1:使用FastDNA SPIN Kit for Soil试剂盒、用FastPrepTM FP120核酸提取仪提取DNA。方法2:使用FastDNA SPIN Kit for Soil试剂盒、用Mini-BeadBeater-16TM核酸提取仪提取DNA。方法3:用GENMED土壤DNA分离试剂盒提取DNA。方法4:用GENMED土壤DNA分离试剂盒与Mini-BeadBeater-16TM核酸提取仪提取DNA。方法5:用GENMED土壤DNA分离试剂盒与Mini-BeadBeater-16TM核酸提取仪提取DNA。方法6:用Mini-BeadBeater-16TM核酸提取仪、GENMED土壤DNA分离试剂盒提取DNA。方法7:用Mini-BeadBeater-16TM核酸提取仪与GENMED土壤DNA分离试剂盒相结合来提取DNA。……

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