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基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析

2017-04-07张怀山鄢秀芹鲁敏王道平安华明

中国农业科学 2017年6期
关键词:资源

张怀山,鄢秀芹,鲁敏,王道平,安华明

(1贵州大学农学院/贵州省果树工程技术研究中心,贵阳 550025;2贵州省中国科学院天然产物化学重点实验室,贵阳550002)

基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析

张怀山1,鄢秀芹1,鲁敏1,王道平2,安华明1

(1贵州大学农学院/贵州省果树工程技术研究中心,贵阳 550025;2贵州省中国科学院天然产物化学重点实验室,贵阳550002)

【目的】通过分析评价贵州野生刺梨(Rosa roxburghii Tratt)资源居群遗传多样性和遗传结构,为刺梨资源的保护和发掘利用提供科学依据。【方法】从刺梨EST-SSR引物中筛选扩增效果好、多态性较高的10对引物,对收集的12个野生刺梨自然居群(共255份资源)的遗传多样性及遗传结构应用POPGENE 1.31软件进行分析,并根据Nei’s标准遗传距离,利用NTSYS-pc2.10e软件对各居群进行聚类分析,同时进行Nei’s遗传距离与地理距离的Mantel相关性检验。【结果】居群内Shannon信息指数(I)为0.62—0.88,基因多样性指数(Nei’s)为0.40—0.52,且除福泉(FQ)和晴隆(QL)居群外,其余10个居群的多态位点百分率均为100%。此外,卡方检验显示12个居群在大多数位点上等位基因显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),且居群内近交系数(Fit)、总近交系数(Fis)均为负值,居群间分化系数Fst平均值0.0403,居群间基因流Nem平均值为5.9484、遗传一致度GI为0.9068—0.9926、最大Nei’s遗传距离为0.0978。各自然居群间Nei’s遗传距离与地理距离存在显著相关性(r=0.2498,P=0.9512)。【结论】10对EST-SSR引物具有高度的多态性,可作为有效的遗传标记用于刺梨居群遗传多样性和遗传结构评价。贵州省野生刺梨自然居群内的遗传多样性较高,存在杂合度过剩的现象,且绝大多数的遗传变异发生在居群内;居群间具有基因交流频繁、遗传一致度高、Nei’s遗传距离小等特点。

刺梨;SSR;遗传多样性;居群遗传结构

0 引言

【研究意义】刺梨(Rosa roxburghii Tratt,2n=2x=14)为蔷薇科(Rosaceae)蔷薇属(Rosa)植物,是中国特有的果树资源。因其果实含有丰富的营养物质和药用保健成分,尤其是极高的维生素C而倍受关注。刺梨作为贵州省重点发展的特色产业,种植面积已超过 300 km2。同时,贵州省还含有丰富的野生刺梨资源,多分布于海拔1 000—1 600 m的山区、丘陵地带[1-2]。这些丰富的野生资源无疑是刺梨品种选育和产业可持续发展的重要基础和必要前提。……

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