李丽莎��+李祥龙��+毛艳朋

摘要：基于生物基因组学数据库，对山羊PMEL基因进行生物信息学分析，为研究该基因的功能提供依据。根据GenBank中山羊PMEL基因编码蛋白序列（GenBank登录号：XP_005680442.1），利用ExPASy数据库中的ProtParam、ProtScale程序分別预测理化性质、疏水性；利用CBS Prediction Servers数据库中的SignalP、TMHMM、Protfun程序分别预测信号肽、跨膜区及其功能；利用Predict Protein、PSORT Ⅱ Prediction、Motif Scan软件分别预测二级结构、亚细胞定位、功能位点，并对不同物种PMEL基因构建系统发育树。结果表明：山羊PMEL基因共编码685个氨基酸，属可溶性不稳定蛋白，无信号肽，在接近肽链的C-端存在1个跨膜区；二级结构以无规卷曲为主，该蛋白主要在内质网中发挥运输、结合、信号转导作用；不同物种PMEL基因的系统进化情况与生物进化过程中的动物学分类相符。山羊PMEL基因编码蛋白在生物进化中具有较强保守性，该基因结构和功能的分析为山羊PMEL基因遗传特性的进一步研究奠定了基础。

关键词：PMEL；山羊；生物信息

中图分类号： Q785；S826.9+2文献标志码：

文章编号：1002-1302（2016）08-0047-04

前黑素小体蛋白（premelanosome protein，PMEL）别称gp100、ME20、PMEL17、silver[1]，由Sliver基因编码，只在皮肤黑色素细胞、眼色素层黑素细胞、视网膜色素上皮细胞中进行表达[2]。前黑素小体蛋白是一种黑色素瘤特异性糖蛋白，对黑素小体的发育具有重要作用，通过形成蛋白水解的纤维状矩阵从而使黑色素沉积[3]。人类PMEL基因编码蛋白是一种黑素细胞特异性糖蛋白[4-5]，该位点编码PMEL17蛋白，与小鼠的silver基因同源，编码的蛋白分子质量为70 ku，由668个氨基酸构成；此外，该基因还编码gp100蛋白，这2种蛋白质通过基因交替剪接成2个竞争性3′接受位点而产生，由于催化活性的不同，这2个位点可产生2种蛋白质[6]。……