下一代测序技术的临床应用规范化问题
——参考美国医学遗传学与基因组学会行业标准
2016-12-16姜烈君陆晓旭黄华艺
姜烈君 陆晓旭 黄华艺,2★
•述评•
下一代测序技术的临床应用规范化问题
——参考美国医学遗传学与基因组学会行业标准
姜烈君1陆晓旭1黄华艺1,2★
[摘要]下一代测序(next generation sequencing,NGS)技术已经在临床实验室中得到应用。该技术的发展以及检测规模和应用范围的扩大,使基因检测成本大大降低。NGS技术在临床上的应用在不断地扩大,如疾病靶向基因组套检测、个体外显子组或全基因组分析等。同时,NGS技术也进一步改善了治疗决策和对某疾病高危人群的预测。然而,NGS技术的发展也充满了挑战性,包括测序平台和技术更新带来的选择困惑、测序结果的临床验证的不一致性问题等。为了帮助临床实验室更好地了解NGS技术、解决临床验证和正确选择NGS测序平台和方法,以及持续监控NGS并保证高质量的测序结果及其临床解释,本文结合美国医学遗传学和基因组学会(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)关于NGS技术在临床上的应用的专业标准和指南进行归纳和讨论,供我国分子诊断工作者制定国内行业标准时参考。
[关键词]美国医学遗传学和基因组学会;下一代测序;疾病靶向的基因组套测序;外显子组测序;全基因组测序
下一代测序(next generation sequencing,NGS)技术是一种利用克隆扩增或单分子模板技术进行的大规模平行测序。NGS技术发展很快,目前已广泛应用于临床。NGS技术具有高通量和低单碱基成本的特点,但至今为止,该技术用于临床检测仍存在许多问题。比如,测序流程的标准化、测序平台和技术原理不同使用户在选择上产生困扰、测序结果中数据分析的差异性以及结果与临床的不一致性问题等。……
