肺炎克雷伯菌携带碳青霉烯酶KPC-2基因环境多态性研究
2016-11-29沈平华蒋晓飞
沈平华, 仉 英, 蒋晓飞
·论著·
肺炎克雷伯菌携带碳青霉烯酶KPC-2基因环境多态性研究
沈平华1, 仉 英2, 蒋晓飞1
目的 研究复旦大学附属华山医院耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌广泛播散初期携带blaKPC-2的完整基因结构,获得其播散的基因背景。方法 收集2006年8月―2009年12月连续不重复的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌42株,进行质粒抽提、blaKPC-2筛选、多位点序列分型(MLST);随后设计一系列PCR引物,对blaKPC-2基因结构进行完整测序。结果 MLST分型显示:34株属于ST11型,5株属于ST423,2株属于ST65,1株属于ST977。主要发现两种携带blaKPC-2基因结构,A型(8/42):Tn1721-blaKPC-2-Tn3;B型(34/42):Tn1721-blaKPC-2-ΔTn3-IS26,且B型结构的两端序列存在差异。结论 该组中肺炎克雷伯菌携带blaKPC-2的基因结构存在多态性,Tn1721-blaKPC-2-ΔTn3-IS26样结构占优势。研究获得的携带blaKPC-2基因结构及侧翼的完整序列,为进一步正确认识和理解blaKPC-2的播散模式和机制提供了完整的基因背景。
肺炎克雷伯菌; 碳青霉烯类耐药; KPC-2; 基因环境
碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的全球蔓延,已经成为临床治疗的巨大难题。KPC (Klebsiella pneumoniae carbapenemases)是导致肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类耐药的主要原因[1-2],而KPC-2是KPC中最常见的类型之一[3]。
2007年,中国浙江杭州地区出现了首个关于KPC-2的报道,该报道中blaKPC-2位于一株临床肺炎克雷伯菌的质粒pKP048(GenBank accession no: FJ628167.2)上[4],通过全质粒测序可知blaKPC-2位于一个完整的Tn1721样转座子中。此后,在上海地区的一株临床肺炎克雷伯菌中发现质粒pKPHS2 (GenBank accession no: CP003224.1) 上Tn1721结构被IS26在Tn3的tnpR处打断,造成tnpATn3和IRL2Tn1721的丢失,形成了Tn1721-blaKPC-2-ΔTn3-IS26样的新结构[5]。
blaKPC-2的基因环境是了解blaKPC-2播散途径的重要信息,是进行有效医院感染控制的基础。本研究将华……
