基于转录组测序对茶树GST基因表达的研究
2016-10-27张亚真韦康王丽鸳成浩
张亚真,韦康,王丽鸳,成浩
基于转录组测序对茶树基因表达的研究
张亚真,韦康*,王丽鸳,成浩
中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心农业部茶树生物学与资源利用重点实验室,浙江杭州 310008
谷胱甘肽转移酶(Glutathione-transferases,)在植物体内普遍存在,是一类具有多种生物学功能的超家族蛋白酶。本研究通过对中黄2号、龙井43在正常光照和遮荫处理下的转录组测序,筛选获得了49个基因家族成员,并对其中19个在芽叶中表达量较高的基因进行了序列分析和聚类分析。另外对表达量较高的8个候选基因进行荧光定量表达分析,研究它们在龙井43不同叶位中的表达模式。结果表明这些基因在一芽一叶到第六叶中均有表达,但各自呈现出不同的变化规律。在龙井43一芽一叶到第六叶中的表达量逐渐上升,可能与植物抗胁迫有关,而的表达量则显著下降,可能与花青素代谢有关。
茶树;转录组测序;谷胱甘肽转移酶;表达分析
谷胱甘肽转移酶()是一类由多基因编码、具有多种功能的超家族蛋白酶,普遍存在于动物、植物及微生物中。根据基因结构及蛋白同源性可分为8类,即phi(F型)、tau(U型)、zeta(Z型)、theta(T型)、lambda(L型)、脱氢抗坏血酸还原酶(Dehydroascorbate reductase, DHAR)、四氯代氢醌脱卤素酶(Tetrachlorohy droquione dehalogenase, TCHQD)和微粒体GST(Membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism, MAPEG),除微粒体GST外,其他7类均为可溶性GST,且GSTF和GSTU一般只存在于植物体内,含量较高,种类也最为丰富[1]。自20世纪70年代在玉米中首次发现GST以来[2],许多植物中的GST也都相继被发掘。目前,基因已在17种植物中得到克隆和研究[3],如拟南芥中有54个基因,水稻59个,玉米42个,大豆26个[4]。……
