干酪中肠球菌种群的遗传差异及万古霉素抗性基因分析
2016-09-19倪永清
于 洋,倪永清*
(石河子大学食品学院,新疆石河子832000)
干酪中肠球菌种群的遗传差异及万古霉素抗性基因分析
于洋,倪永清*
(石河子大学食品学院,新疆石河子832000)
通过种、属引物特异性扩增、重复序列PCR(rep-PCR)技术和万古霉素抗性基因检测对新疆北疆地区干酪样品中球菌的遗传结构差异进行分析。结果表明,15份样品共分离52株肠球菌,包括31株耐久肠球菌(Enterococcusdurans)、18株粪肠球菌(Enterococcusfaecalis)和3株屎肠球菌(Enterococcusfaecium)。依据rep-PCR遗传指纹带谱分析,52株菌可以聚类成7个群,其中4个由E.durans构成。24株肠球菌检测到了万古霉素抗性基因,17株E.durans为VanC2/C3型,4株E.faecalis为VanC1型,2株E.faecium为VanB型,只有1株E.faecium为VanA型。新疆北疆地区干酪中肠球菌种群分布较为广泛,地域之间优势种群和基因型不同,同种肠球菌菌株之间存在广泛的遗传差异。
干酪;肠球菌;重复序列PCR;万古霉素
肠球菌(enterococci)属于乳酸菌(lactic acid bacteria,LAB),是一类共生于人和其他哺乳动物肠道的革兰氏阳性菌,也是人和哺乳动物肠道菌群的重要组成。最早分离的菌株大多来自人和哺乳动物肠道,陆续研究发现肠球菌广泛分布于自然界的其他生态环境中,如健康人体的上呼吸道、口腔,甚至昆虫体内[1]。除此之外,肠球菌更广泛的存在于各种食品中,如干酪、牛奶、肉制品和蔬菜等[2]。
我国新疆北疆地区气候季节变化明显,有辽阔的天然牧场,生活在该地区的哈萨克族和维吾尔族等少数民族世代以原奶制作各种传统发酵乳制品,其中干酪(维语“库鲁特”)是生活在牧区的牧民最常见的食物。到目前为止,虽然关于新疆地区乳制品中乳酸菌多样性的研究报道较多[3-6],但针对专一属的同一类乳酸菌深入开展群体表型和遗传差异的研究很少。……
