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拟南芥硫苷生物合成相关基因的组织和胁迫诱导表达谱的全基因组分析

2016-09-16马珊珊柯蕴倬孙丽萍李加纳

中国农业科学 2016年15期
关键词:生物

杜 海,冉 凤,刘 静,文 婧,马珊珊,柯蕴倬,孙丽萍,李加纳

(西南大学农学与生物科技学院,重庆400715)

拟南芥硫苷生物合成相关基因的组织和胁迫诱导表达谱的全基因组分析

杜 海,冉 凤,刘 静,文 婧,马珊珊,柯蕴倬,孙丽萍,李加纳

(西南大学农学与生物科技学院,重庆400715)

【目的】分析拟南芥中硫代葡萄糖苷(Glucosinolatcs,简称硫苷)生物合成相关基因在不同组织器官、不同发育时期及不同生物和非生物胁迫处理条件下的表达谱,为筛选控制硫苷合成的关键基因、解析硫苷的生物合成规律及其在植物抗逆胁迫过程中的作用奠定基础。【方法】利用AtGenExpress和PLEXdb中的10组表达谱芯片数据和2组转录组数据分析拟南芥中硫苷生物合成途径82个结构基因和调控基因的时空表达特性及其受生物和非生物胁迫的表达模式;采用Real-time PCR技术对10个硫苷合成途径的关键结构基因和调控基因的表达谱进行验证;并利用STRING v10软件分析硫苷生物合成途径相关基因的表达模式的相关性。【结果】组织表达特性分析结果表明,拟南芥硫苷生物合成相关基因在营养器官和生殖器官中的表达模式差异较大,相关基因在营养器官中具有较高的表达量,在生殖器官中的表达量则较低,表明硫苷主要在营养组织中合成;其中脂肪族硫苷合成相关基因在茎、叶等地上营养组织中的表达量较高,而吲哚族硫苷合成相关基因则在根、茎、叶等地上和地下组织中均有较高的表达,且基因在同一组织的不同发育时期的表达量通常具有差异,表明基因的表达还具有时空特异性;……

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