隋雨菲，欧阳立明，鲁洪中，庄英萍，张嗣良

华东理工大学 生物反应器工程国家重点实验室，上海 200237

综 述

黑曲霉组学研究进展

隋雨菲*，欧阳立明*，鲁洪中，庄英萍，张嗣良

华东理工大学 生物反应器工程国家重点实验室，上海 200237

隋雨菲， 欧阳立明， 鲁洪中， 等. 黑曲霉组学研究进展. 生物工程学报， 2016， 32（8）: 1010-1025.

Sui YF， Ouyang LM， Lu HZ， et al. Progress in omics research of Aspergillus niger. Chin J Biotech， 2016， 32（8）: 1010-1025.

黑曲霉作为重要的工业发酵菌株，被广泛用于多种有机酸和工业用酶的生产。随着组学技术的日益发展和成熟，黑曲霉的基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等组学数据不断增长，宣告着黑曲霉生物过程研究大数据时代的到来。从单一组学的数据分析、多组学的比较到以基因组代谢网络模型为中心的多组学整合研究，人们对黑曲霉高效生产机制的理解不断深入和系统，这为通过遗传改造和过程调控对菌株的生产性能进行理性的全局优化提供了可能。本文回顾和总结了近年来黑曲霉的组学研究进展，并提出黑曲霉组学研究未来的发展方向。

黑曲霉，基因组，转录组，蛋白质组，代谢组，组学整合，基因组规模代谢网络模型

黑曲霉 Aspergillus niger是一种丝状子囊真菌，在环境中十分常见［1］。在自然生长状态下，黑曲霉分泌大量多种用途的酶降解环境中的生物聚合物从而获得营养。黑曲霉生产的工业酶在淀粉加工、发酵、酿造、饮料生产动物饲料和造纸行业等领域发挥了巨大的作用。此外，黑曲霉还可以作为异源蛋白的生产宿主及生产柠檬酸和葡萄糖酸的细胞工厂，因其具有高产、高分泌、高安全性等优点而被广泛地应用于发酵工业中［2］。……