高通量转录组测序技术研究过表达GPC5对A549细胞基因表达影响
2016-08-31张海天王国祥杨欣邱满堂许林
张海天 王国祥 杨欣 邱满堂 许林
本课题组在前期研究中发现磷脂酰肌醇蛋白聚糖-5(glypican-5, GPC5)在非小细胞肺癌中扮演着抑癌基因的角色,且GPC5在非小细胞肺癌组织中显著低表达,而过表达GPC5可以显著抑制肺癌细胞的侵袭和迁移能力[1]。此后,陆续有研究[2,3]报道GPC5在肺癌中低表达且具有抑癌基因样作用。
目前的研究多认为GPC5是一个转移抑制因子,而GPC5对细胞增殖影响的研究较少;此外,GPC5的具体分子生物学机制尚未明确。因此,在本研究中我们构建了稳定高表达GPC5的肺腺癌A549细胞株,通过细胞生物学实验和高通量转录组测序手段来研究GPC5对肺腺癌细胞增殖能力和基因表达的影响
1 材料与方法
1.1 实验材料 人肺腺癌细胞株A549购于中国科学院上海细胞库;慢病毒载体及稳定转染细胞株由上海吉凯生物公司完成;RNA提取试剂Trizol购于Invitrogen公司。1640培养基和胎牛血清购于Gibco公司,Cell Counter Kit8(CCK8)和EdU试剂盒购于南京凯基生物公司。
1.2 细胞培养 肺腺癌细胞株A549在含10%FBS的1640培养液中,37oC、5%CO2保持饱和湿度培养,2天-3天传代一次[4]。
1.3 CCK8实验 将处于对数生长期的细胞接种于96孔板,每孔接种3,000个细胞,每组设置5个复孔;分别在接种细胞贴壁后的0 h、24 h、48 h、72 h、96 h吸去培养基,每孔加入100 μL培养液和10 μL CCK8试剂,孵育2 h后使用自动酶标仪检测450 nm波长处吸光值[5]。
1.4 平板克隆实验 将处于对数生长期的细胞接种于6孔板,每孔接种200个细胞,每4天换液一次。2周后吸去培养基,使用甲醇将细胞克隆固定,然后用结晶紫染液染色,计数每个孔中克隆形成数目并拍照。
1.5 EdU实验 将处于对数生长期的细胞均匀接种与盖玻片上,待细胞贴壁后使用凯基EdU试剂盒进行染色固定并拍照。……
