GIV诺如病毒荧光定量一步RT-PCR方法的建立
2016-08-19敖元云虞结梅周冬梅靳淼李莉莉段招军
敖元云 虞结梅 周冬梅 靳淼 李莉莉 段招军
100052北京,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室
GIV诺如病毒荧光定量一步RT-PCR方法的建立
敖元云 虞结梅 周冬梅 靳淼 李莉莉 段招军
100052北京,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室
目的 建立灵敏、特异的GIV诺如病毒的荧光定量检测方法。方法 合成针对GIV诺如病毒的特异性引物以及Taqman探针,优化反应体系及条件,根据我国新发人GIV诺如病毒序列(GenBank序列号:KC894731)构建荧光定量检测的RNA标准品,对其灵敏度、特异性、重复性进行评估,以传统逆转录-聚合酶链反应(Reverse transcription-po1ymerase chain reaction,RT-PCR)的方法作为参考评价。结果 该方法检测的灵敏度可以达到1.0×102拷贝/μ1,检测范围为102~108拷贝/ μ1;与GI、GII诺如病毒、肠道腺病毒、轮状病毒、星状病毒等无交叉反应;批内和批间重复性实验的循环阈值(Ct)变异系数(CV)分别小于1.31%和3.68%;在阳性粪便标本的对比检测中发现,该方法与普通RT-PCR相比具有灵敏度高、能够定量的优势。结论 本研究建立的检测GIV诺如病毒的荧光定量一步RT-PCR法,可应用于GIV诺如病毒的检测。
【主题词】 诺如病毒;GIV;荧光定量
诺如病毒(Norovirus,NoV)是单股正链、无包膜的RNA病毒,属于杯状病毒科诺如病毒属,是引起全世界所有人群非细菌性胃肠炎的主要病原体之一[1]。根据诺如病毒衣壳区的核苷酸序列,将NoV分为5个基因组(genogroup,G),GI-GV,感染人的包括GI、GII和GIV,而GIII和GV分别感染牛和鼠。GIV进一步分为两个基因型,感染人的GIV.1型和感染动物的GIV.2型[2]。GI和GII是诺如病毒引起胃肠炎暴发最常见的两个遗传组[3-4],而GIV引起暴发的报道却是很少见,我国目前未见有关GIV NoVs报道。……
