贾宝迁 肖艳 王营 任丽丽 王健伟

作者单位：100730中国医学科学院病原生物学研究所

2013-2015年人冠状病毒OC43基因型分布特点的研究

贾宝迁 肖艳 王营 任丽丽 王健伟

作者单位：100730中国医学科学院病原生物学研究所

目的 研究人冠状病毒（Human Coronavirus，HCoV）OC43的基因型分布特点，为阐明HCoV-OC43的分子流行规律提供数据参考。方法 从2013年-2015年HCoV-OC43检测阳性的呼吸道样本中提取核酸，用逆转录方法扩增cDNA，利用特异性引物扩增全长纤突蛋白基因（S）、聚合酶基因（RdRp）和核蛋白基因（N）。用Mega 6.0软件进行序列拼接、进化树构建和S蛋白氨基酸比对。结果 从16份HCoV-OC43阳性样本中获得全长S、RdRp和N基因。其中2013年的1株为D基因型，2014年的8株均为D基因型，2015年的7株中包括3株B、3株D和1株E（CH）基因型。B和D基因型的S蛋白分别有9个和16个氨基酸位点的突变与分离年份有关，B基因型中氨基酸突变呈累加现象，D基因型中出现连续突变和回复突变。结论 HCoV-OC43表现为多基因型共流行，D基因型高流行。抗原蛋白S的氨基酸突变在各基因型流行中起重要作用。本研究为完善和丰富对HCoVOC43的分子流行特征的认识提供了数据参考。

【主题词】 人冠状病毒OC43；基因型；突变；流行

Fund programs：Nationa1 Major Science&Techno1ogy Project for＂Contro1 and Prevention of Major Infectious Diseases of China＂ （2012ZX10004206）；New Century Exce11ent Ta1ents in University （3332013127）

人冠状病毒（Human Coronavirus，HCoV）是常见的呼吸道病毒，为巢病毒目冠状病毒科冠状病毒属成员，是有包膜的单股负链RNA病毒［1］。在已经发现的六种HCoV（229E、NL63、OC43、HKU1、SARSCoV和MERS-CoV）中，HCoV-OC43在人群中的检出频次最高，且由于其从1967年就被发现，是用于研究HCoV分子流行特点的重要模型［1，2］。HCoVOC43基因组全长约30.7 kb。编码包含16个非结构蛋白的开放阅读框架1ab、ORF2a、血凝素-酯酶蛋白、纤突蛋白（Spike，S）、ORF5a、小囊膜蛋白、膜蛋白和核衣壳（Nuc1eocapsid，N）蛋白［1］。……