2012-2013年广州市5起胃肠炎暴发中诺如病毒的分子流行病学特征
2016-08-19谢华萍耿进妹刘静雯陈纯蔡文锋狄飚袁俊
谢华萍 耿进妹 刘静雯 陈纯 蔡文锋 狄飚 袁俊
510440广州市疾病预防控制中心
2012-2013年广州市5起胃肠炎暴发中诺如病毒的分子流行病学特征
谢华萍 耿进妹 刘静雯 陈纯 蔡文锋 狄飚 袁俊
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目的 了解2012年12月至2013年1月期间我国广州5起胃肠炎暴发诺如病毒的分子流行病学特征。方法 收集2012年12月至2013年1月广州市5起胃肠炎暴发(A-E)共274份粪便标本和流行病学资料,利用RT-PCR方法对诺如病毒进行检测,对扩增产物进行序列测定。用C1usta1 X 1.83和MEGA 5.05生物软件对诺如病毒序列进行序列比对和系统进化分析。用SPSS17.0软件进行统计分析。结果 诺如病毒的总阳性率为20.07%(55/274),其中,A高校诺如病毒阳性率为8.70%(2/23)、B幼儿园为36.36%(8/22)、C高校为36.07%(22/61)、D社区卫生中心为100% (5/5)、E高校为11.04%(18/163),60岁及以上年龄组诺如病毒阳性率为100%(6/6),10-19岁年龄组为47.37%(9/19),9岁及以下年龄组为36.36%(8/22)。系统进化分析表明33份成功分型的阳性标本均为诺如病毒GⅡ.4型新变异株Sydney 2012感染。结论 诺如病毒是引起广州市急性胃肠炎暴发的主要病原之一,GⅡ.4型新变异株Sydney 2012是当年流行的优势毒株。
【主题词】 诺如病毒;急性胃肠炎;暴发;Sydney 2012变异株
【Key words】Norovirus;Acute gastroenteritis;Outbreak;Sydney 2012 variant
Fund programs:Key Medicine Discip1ine Construction of Guangzhou Municipa1ity(2013-2015-07);Guangzhou Medica1 and Hea1th Science and Techno1ogy Project(20151A011057)
人诺如病毒属于杯状病毒科,是导致世界范围内胃肠炎暴发的主要病原,尤其是在医院、学校、监狱、养老院等相对封闭的环境。其流行在全世界范围内造成了较高的发病率、病死率以及严重的经济负担[1],尤以儿童、老年人、免疫抑制人群和免疫缺陷人群为主[2]。
诺如病毒是单链正股RNA病毒,基因组长度约7.5~7.7 kb,5′末端为一帽状结构,3′末端为多聚A尾。根据其VP1区或RdRp区核苷酸序列的不同,诺如病毒可被分为至少6个基因组(genogroup,GIGVI),其中,GI、GⅡ、GⅣ可感染人,以GI和GⅡ组诺如病毒最为常见[3]。……
