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小尾寒羊间情期和发情期microRNAs差异表达分析

2016-08-09段新崇魏彦辉李相运周荣艳锡建中

畜牧兽医学报 2016年7期

段新崇,魏彦辉,李 阳,李相运,周荣艳,锡建中

(河北农业大学动物科技学院,保定 071001)



小尾寒羊间情期和发情期microRNAs差异表达分析

段新崇,魏彦辉,李阳,李相运,周荣艳*,锡建中

(河北农业大学动物科技学院,保定 071001)

摘要:本研究通过构建和分析小尾寒羊间情期和发情期卵巢组织microRNA(miRNA)表达谱,筛选两个时期差异表达的microRNAs,为研究microRNA调控小尾寒羊繁殖过程提供相应的理论基础。利用活体手术法在发情期(第1天)和间情期(第13天)分别采集一侧卵巢。从卵巢中提取总RNA,利用illumina Hiseq2000测序平台获取RNA数据,对表达谱和差异表达microRNAs进行生物信息学分析。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达的microRNAs在小尾寒羊卵巢中表达水平。结果,成功地构建出小尾寒羊间情期和发情期microRNA的表达谱,oar-miR-99a和oar-miR-143分别是间情期和发情期表达量最高的microRNA,并筛选出在两个时期间3个显著差异表达的microRNAs,分别为oar-miR-200a、oar-miR-200b和oar-miR-200c。利用qRT-PCR对随机选择的2个显著差异表达的microRNAs进行验证,其表达水平和RNA-Seq分析结果一致。microRNA表达谱为后续的绵羊卵巢microRNA研究提供更详尽的信息。结合靶基因预测及通路富集分析,推测差异表达的microRNAs是通过代谢和免疫途径调控卵巢周期性活动。

关键词:小尾寒羊;间情期;发情期;卵巢;microRNA

microRNA是一类长约22个核苷酸的非编码单链RNA分子,在哺乳动物的卵巢、输卵管、子宫、胎盘等繁殖组织器官中广泛表达[1-3]。它通过与靶mRNA特异性碱基互补配对,引起靶mRNA降解或者抑制其翻译,发挥基因转录后水平调控作用,从而参与细胞分化、增殖、凋亡等一系列生物学过程,而这些生物学过程正是卵泡发生、排卵以及黄体生成所必须的过程[4]。……

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