甘霖　滕峥　王嘉瑜　张勇　许文波　钟照华　张曦　严冬梅



·论著·

2014年上海市手足口病的病原谱及EV-A71和CV-A16分子流行病学特征分析

甘霖滕峥王嘉瑜张勇许文波钟照华张曦严冬梅

150081 哈尔滨医科大学微生物教研室(甘霖、钟照华)； 200336 上海市疾病预防控制中心(滕峥、王嘉瑜、张曦); 102206 北京，中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所，卫生计生委医学病毒与病毒病重点实验室，世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室(张勇、许文波、严冬梅)

甘霖、滕峥对本文有同等贡献，并列第一作者

【摘要】目的研究2014年上海市手足口病的病原谱，及肠道病毒A组7l型(EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)变异变迁规律。方法采集上海市2014年手足口病患者的咽拭子标本，进行核酸检测，对核酸检测结果为EV-A71、CV-A16以及其他EV阳性的临床标本进行病毒分离。对病毒分离结果阳性株进行全长VP1编码区基因的扩增以及核苷酸序列的测定和分析，然后与EV-A71、CV-A16各基因型和基因亚型的代表株构建亲缘性进化树。结果2014年上海市辖区共对2017例HFMD临床标本进行了核酸检测，共有1 644例检测结果为阳性。从中随机地选择出75份临床标本接种RD细胞和Vero细胞，共有60份出现EV特征性CPE，病毒分离的阳性率为82.67%,其中23株被鉴定为EV-A71、32株被鉴定为CV-A16、5株被鉴定为其他EV。23株EV-A71全部属于C4a进化分支；32株CV-A16中，有8株属于B1a进化分支，有24株属于B1b进化分支。 结论2014年上海市辖区手足口病呈现EV-A71与CV-A16共同流行的模式。C4a进化分支的EV-A71在上海市持续传播，而B1b进化分支成为上海市CV-A16的流行优势株。……