GeXP联合多重PCR系统在腹泻病毒检测中的应用
2016-08-09石莹陈肖潇樊学军田绿波杨雨张薇薇
石莹 陈肖潇 樊学军 田绿波 杨雨 张薇薇
·技术方法·
GeXP联合多重PCR系统在腹泻病毒检测中的应用
石莹陈肖潇樊学军田绿波杨雨张薇薇
610041 成都,四川出入境检验检疫局国际旅行卫生保健中心(石莹、陈肖潇、樊学军、田绿波、杨雨);610500 成都医学院公共卫生系(张薇薇)
【摘要】目的利用GeXP系统结合多重PCR技术,建立诺如病毒(GI和GII组)、轮状病毒、星状病毒的方法。方法根据4种病毒的序列特征,制备病毒标准品质粒,收集病原体样本,利用GenBank下载4种病毒的核苷酸序列,根据4种病毒的序列特征,利用GeXP express Profiler设计特异性引物,优化条件使GeXP系统能够特异性、快速的检测对应病毒。评价其灵敏度、特异性及功效,并应用于120份临床标本检测。结果优化后的引物能特异性的检测各病毒,无交叉反应;灵敏度为100%,特异性为99.53%,功效为99.62%,与荧光定量PCR检测结果一致性为99.51%,检测浓度最低至5×103/μl拷贝,在已知临床样本灵敏度高、特异性好。结论GeXP方法的建立为快速、准确的检测这4种腹泻病毒提供了便利,对口岸突发群体性腹泻的病原体检出有重要意义。
【主题词】腹泻病毒;GeXP;多重PCR
Fund programs: General Administration of Quality Supervision, Inspection and Quarantine Public Benefit Research Foundation of China (201210046);General Administration of Quality Supervision, Inspection and Quarantine Research Foundation of China (2014IK064);Sichuan Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau Research Foundation (SK201402)
病毒性腹泻因其传播速度快,临床上难区分,给诊断及治疗带来了极大的困难。引起病毒性腹泻的主要病原体有轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒和星状病毒等[1]。诺如病毒是成人病毒性腹泻最主要的原因,其次依次为轮状病毒、星状病毒和腺病毒[2-3]。诺如病毒根据其基因特征,主要分为6个基因型,GI、GII 和GIV基因型主要感染人类,而GIII 和GV可感染猪、牛和鼠[4]。……
