王楷宬，王 通，庄青叶，邱 源，彭 程，王素春，陈继明

（中国动物卫生与流行病学中心，山东青岛 266032）



习题与答案

甲型流感病毒快速分型与分析软件的开发与试用

王楷宬，王 通，庄青叶，邱 源，彭 程，王素春，陈继明

（中国动物卫生与流行病学中心，山东青岛 266032）

摘 要：甲型流感病毒危害动物和人类健康，其亚型多、突变率高、易发生重配，因此对其进行检测及流行毒株基因分析尤为重要。为解决传统方法进行大量甲型流感病毒序列分型和分析时存在的费工耗时、人为错误多等问题，结合实际工作需要，使用Perl语言建立了一套lunix系统下的甲型流感病毒快速分型与分析软件，并试用其对GenBank中所有宿主为鸭的甲型流感病毒进行了分析。结果显示，该软件可在较短的时间内完成大量序列的分析、分型和遗传进化研究，可用于甲型流感病毒的大规模流行病学调查分析。

关键词：甲型流感病毒；基因分析；亚型；遗传进化

甲型流感病毒能感染多种宿主，包括家禽、猪、马、野生鸟类和人等温血动物。有关甲型流感流行的记录已超过百年[1]，先后造成了1918年、1957年、1968年和2009年四次全球性流感大流行，对人类的生命健康和社会生活形成了巨大威胁。对兽医工作有重要意义的禽流感病毒也属甲型流感病毒。在我国，有多种亚型的甲型流感病毒流行，时有导致动物疫情和公共卫生事件的发生，如2013年发生的“H7N9流感事件”[2]。

甲型流感病毒属于正黏病毒科、流感病毒属的单股负链RNA病毒，其基因组由8个单股负链RNA片段组成[3]。……