王楷宬，邱 源，庄青叶，张笑春，王　通，陈继明

（中国动物卫生与流行病学中心，山东青岛 266032）



高通量测序分析1株H7N9流感病毒的全基因

王楷宬，邱 源，庄青叶，张笑春，王通，陈继明

（中国动物卫生与流行病学中心，山东青岛 266032）

摘要：为探索利用高通量测序开展H7N9亚型流感的监测、全基因分析和溯源研究的方法，使用Ion Torrent PGM测序仪对1株H7N9流感病毒进行了全基因测序，分析了此毒株的基因组特性和进化特征。结果显示，该毒株与2013年引起我国华东地区疫情的H7N9流感毒株的亲缘关系较近；纵观在不同年代和地点分离的H7N9流感病毒的6个内部基因，2013年疫情之前和之后的H7N9流感病毒存在明显差异。

关键词：H7N9流感病毒；高通量测序；基因组；分子演化

资助项目：科技部科技基础性专项（SQ2012FY3260033）；中国动物卫生与流行病学中心创新基金（2015IF-0004FF）

H7N9 流感病毒属于正粘病毒科、甲型流感病毒属。与其他甲型流感病毒一样，H7N9 流感病毒为有包膜、分节段、单负链RNA 病毒，基因组包括8 个片段。根据HA 和NA 抗原性的差异，甲型流感病毒可分为若干亚型，迄今已发现18种HA亚型（H1～H18）和11种NA亚型（N1～N11）[1-3]。任何一对HA 和NA 均可组合成一个亚型， 如H1N1、H5N1、H7N9等。

甲型流感病毒的宿主广泛，在人类中流行的有H1N1、H2N2 和H3N2 亚型，禽类常感染H5N1、H5N9、H3N8、H9N2、H5N2和H6N5等亚型[4]。禽类携带的流感病毒偶尔可感染人类，现已证实能直接感染人类的禽流感病毒有H5N1[5]、H9N2[6]、H7N2[7]、H7N3[8]、H7N7[9]、H7N9[10]、H5N2[11]、H10N7[12]和H10N8[13]等。

自2013 年2 月19 日开始，我国东南部的上海、安徽等地陆续发现由甲型H7N9 流感病毒引起的人感染病例。全基因系统进化分析表明，此次引起人类感染的H7N9 流感病毒与以前在禽类中发现的H7N9流感病毒完全不同，是一种从未出现过的新型流感病毒[10]。……