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人FOXA1蛋白的原核表达、纯化及蛋白互作分析*1

2016-07-18谭拥军陈竹林陈团辉

关键词:原核表达

谭拥军,陈竹林,陈团辉,向 勤

(湖南大学 生物学院,湖南 长沙 410082)



人FOXA1蛋白的原核表达、纯化及蛋白互作分析*1

谭拥军†,陈竹林,陈团辉,向勤

(湖南大学 生物学院,湖南 长沙410082)

摘要:构建FOXA1的原核表达载体,诱导表达并纯化后获得人FOXA1的C端和N端蛋白片段,为寻找FOXA1的互作蛋白提供材料基础.提取人乳腺癌细胞MCF7的总RNA,逆转录成cDNA,设计引物PCR克隆FOXA1的cDNA,再以此为模板扩增FOXA1的C端、N端cDNA片段,分别并克隆进带有GST标签的原核表达载体pGEX-4T-1,构建重组表达质粒.双酶切及测序鉴定正确后,转化至大肠杆菌BL21 Rosetta DE3,经IPTG诱导,Glutathione Sepharose 4B亲和纯化,通过SDS-PAGE电泳及Western blot确定FOXA1蛋白的表达.与MCF7细胞裂解液孵育,进行GST-Pull down试验,检测纯化蛋白与FOXA1已知互作蛋白TLE3的相互作用.成功构建pGEX-4T-1-FOXA1-C和 pGEX-4T-1-FOXA1-N的原核表达载体;在大肠杆菌中诱导目的蛋白表达;经Glutathione Sepharose 4B纯化后,获得了人FOXA1的C端蛋白片段GST-FOXA1-C与N端蛋白片段GST-FOXA1-N;证实GST-FOXA1-C能与FOXA1已知互作蛋白TLE3的相互作用.

关键词:转录因子FOXA1;原核表达;相互作用蛋白

转录因子FOXA1属于叉头框(Forkhead Box, Fox)转录因子家族的FOXA亚家族[1].FOX基因广泛地分布于从酵母到人的各种真核生物中,构成一个庞大的转录因子家族.其中在哺乳动物中就拥有40个以上成员,分别参与细胞分化、增殖、代谢及细胞凋亡等生理过程的调节[2]. FOXA1是该家族最早被克隆的成员[3].

FOXA1蛋白介导许多蛋白的相互作用,调节发育、代谢和肿瘤的发生.FOXA1的功能区域由 DNA结合区和转录激活区构成.作为先锋转录因子,FOXA1的羧基端能与核心组蛋白H3,H4相互作用[4]加强了FOXA1蛋白与核小体的结合能力.有研究表明转录因子FOXA1 羧基端的转录激活区可以招募TLE3/GRG3结合到染色质上[5].而FOXA1 DNA结合区可以干扰转录因子NKX2.1与DNA的结合功能从而抑制NKX2.1转录复合物的形成,抑制脑肺和甲状腺的发育[6].此外,FOXA1的DNA结合区还介导FOXA1与雄激素受体(AR)的相互作用[7],而在乳腺癌细胞株中,雌激素的应答在一定程度上依赖于FOXA1的表达[8-9].

为了进一步研究FOXA1在细胞中扮演的角色,本研究通过基因工程技术体外构建表达载体,诱导可溶性融合蛋白 GST-FOXA1-C和GST-FOXA1-N 的高效表达并亲和纯化.利用 GST-Pull down技术,在乳腺癌细胞MCF7中证实GST-FOXA1-C可与已知的FOXA1结合蛋白TLE3发生相互作用,证明纯化蛋白结构正确且能与其互作蛋白发生互作,为进一步寻找FOXA1的互作蛋白提供材料基础.

1材料与方法

1.1菌种、质粒、细胞系

大肠杆菌DH5α感受(北京鼎国),大肠杆菌BL21 Rosetta(DE3)感受态(广州百恩维),质粒pGEX-4T-1由本实验室保存,乳腺癌细胞MCF7为本实验室冻存.

1.2主要试剂

限制性内切酶BamHI,XhoI,T4 DNA连接酶均购自Fermentas公司,M-MLV逆转录酶购于Promega公司,DNA高保真聚合酶购于TOYOBO公司,PCR 引物由上海生工生物公司合成,Glutathione Sepharose 4B购于GE,GST抗体购于碧云天,V5抗体购于Millpore公司.

1.3重组质粒pGEX-4T-1-FOXA1-N,pGEX-4T-1-FOXA1-C的构建及其鉴定

根据NCBI检索到的人源FOXA1的cDNA序列以及空载体PGEX-4T-1的多克隆位点确定FOXA1的上下游引物如表1所示.上游引物为CCC GGA TCC ATG TTA GGA ACT GTG AAG,下划线为BamH I 酶切位点,下游引物为CGC TCT AGA GGA AGT GTT TAG GAC GGG,下划线为EcoR I 酶切位点.以人的乳腺癌细胞MCF7提取细胞总RNA,逆转录成cDNA,再以cDNA为模板进行PCR扩增,扩增条件为94 ℃ 2 min ;98 ℃ 10 s,68 ℃ 90 s,68 ℃ 10 min,32个循环.将 PCR产物克隆入pGEX-4T-1质粒中,双酶切鉴定后送上海生工测序.以测序正确的pGEX-4T-1-FOXA1为模板,FOXA1-C上游引物GCG CGA ATT CAA CCA CCC GTT CTC CAT CAA,FOXA1-C下游引物GCG CCT CGA GTC ATT GGT AGT ACG CCG GCT CCA G;FOXA1-N上游引物GCG CGA ATT CAT GTC CTA GGC CAA CCC GG,FOXA1-N下游引物GCG CCT CGA GCT AGG CGT GCG GGT AGC TGC GC.分别克隆FOXA1的C端(第397到第461个氨基酸)、N端(第66到第218个氨基酸).

表1 质粒克隆引物

1.4GST-FOXA1-C,GST-FOXA1-N融合蛋白的纯化及其鉴定

将测序正确的pGEX-4T-1-FOXA1-N,pGEX-4T-1-FOXA1-C转化入BL21 Rosetta DE3感受态细胞,挑取阳性单克隆,加入含有氨苄青霉素和氯霉素的LB培养基中,37 ℃,培养至OD值在0.6~1.0之间,加入终浓度为0.8 mmol/L IPTG,32 ℃诱导4 h后收集菌液,溶菌酶酶解30 min,超声破碎,取上清加入GST-beads室温孵育30 min后,加入Elution Buffer洗脱,收集洗脱后的蛋白,考染和免疫印迹鉴定.

1.5GST pull down

MCF-7细胞培养至60%~90%时,脂质体转染带V5标签的TLE3真核表达质粒,48 h后收集转染后的细胞,加入500 μL IP裂解液冰上裂解1 h,13 000 r/min,4 ℃,离心15 min,收集上清,即为总的细胞裂解液.向收集的细胞裂解液中加入20 μL GST-beads,4 ℃,孵育2 h,离心收集上清,一分为二,分别加入20 μL GST-beads和纯化后的GST-FOXA1-C,GST-FOXA1-N蛋白,4 ℃旋转结合2 h,4 000 r/min离心收集珠子,用预冷的GST Lysis Buffer漂洗3次,加入Elution Buffer洗脱,收集洗脱后的蛋白,进行考染和免疫印迹鉴定.

2结论

2.1人FOXA1基因全长的扩增

MCF7细胞 RNA的提取按照Total RNA KitI试剂盒(Omega,USA)进行,运用M-MLV逆转录酶(Invitrogen,USA)将RNA反转录为cDNA.通过NCBI查询人FOXA1的cDNA序列设计一对引物,再以cDNA为模板PCR扩增人的FOXA1全长(图1)所示,通过PCR扩增出来的FOXA1 cDNA大小为1 400 bp左右,与NCBI查询的大小基本一致.

M1:DNA Maker;M2:DNA Maker;

2.2重组质粒pGEX-4T-1-FOXA1-N,pGEX-4T-1-FOXA1-C的构建

再以此为模板扩增FOXA1-C/FOXA1-N,大小分别为196 kb,459 kb,与预期大小一致.将PCR克隆获得的片段克隆至表达载体PGEX-4T-1,进行双酶切鉴定如图2所示.我们已经讨论了FOXA1的结构域蛋白在生物体内发挥了重要作用,为了进一步研究其在生物体内的功能,所以克隆出人FOXA1的羧基端和氨基 端蛋白,为后续试验奠定材料基础.

(a):M1:DNA Maker; M2:DNA Maker; 1:GST-FOXA1-C;2:GST-FOXA1-C单酶切;3:GST-FOXA1-C双酶切.(b):M1:DNAMaker; M2:DNA Maker; 1:GST-FOXA1-N; 2:GST-FOXA1-N单酶切; 3:GST-FOXA1-N双酶切

图2重组表达质粒的酶切鉴定

Fig.2Restriction enzyme digestion

by PCR GST-FOXA1-C/GST-FOXA1-N

2.3GST-FOXA-C及GST-FOXA1-N融合蛋白的表达及鉴定

将pGEX-4T-1,pGEX-4T-1-FOXA1-N,pGEX-4T-1-FOXA1-C 3个质粒分别转化进BL21 Rosetta DE3感受态细胞,挑取阳性克隆大规模培养,经IPTG诱导后,收集菌液,Western blot法检测显示,GST-FOXA-C及GST-FOXA1-N融合蛋白均能有效表达(图3).

1:Maker;2:GST蛋白; 3:GST-FOXA1-C诱导前;

2.4GST-FOXA-C与GST-FOXA1-N融合蛋白的纯化

将pGEX-4T-1,pGEX-4T-1-FOXA1-N,pGEX-4T-1-FOXA1-C 3个质粒分别转化进BL21 Rosetta DE3感受态细胞,挑取阳性克隆大规模培养,经IPTG诱导后,收集菌液,酶解,超声破碎.上清用GST-Sepharose4B亲和珠纯化后,经考马斯亮蓝染色结果显示,虽出现不同程度的降解,但均能有效地获得较高浓度的目的GST-FOXA-C及GST-FOXA1-N融合蛋白(图4).

图4 GST-FOXA1-C和GST-FOXA1-N

2.5GST-pull down结果分析

将带有GST-FOXA1-C与GST-FOXA1-N融合蛋白的珠子与过表达的V5-TLE3蛋白的MCF7细胞裂解液孵育后,用V5抗体进行Western blot 法检测(图5)结果显示,GST-FOXA1-C融合蛋白可以与TLE3 蛋白发生结合,而GST蛋白和GST-FOXA1-N融合蛋白在同一位置无此条带,说明FOXA1-C端蛋白结构域能够有效的与TLE3 蛋白特异地相互作用,具有与FOXA1全长蛋白部分相似的生物学功能.

1:过表达V5-TLE3蛋白的MCF7细胞裂解物(Input);2:GST蛋白与Input孵育后的Pull down产物;3:GST-FOXA1-N融合蛋白与Input孵育后的Pull down产物;4:GST-FOXA1-C融合蛋白与Input孵育后的Pull down产物

图5Pull down产物Western blot分析

Fig.5Pull down analysis of SDS-PAGE

and Western blot analysis of the product

2.6Pull down结果的考马斯亮蓝分析

将带有GST-FOXA1-C融合蛋白的珠子与MCF7细胞裂解液孵育后,同时用GST蛋白与MCF7细胞裂解液孵育的结果作为对照,再用洗脱液将Pull down产物洗脱下来,经考马斯亮蓝染色发现,GST-FOXA1-C融合蛋白能够拖下许多与FOXA1-C端相结合的互作蛋白,从而为后面的实验奠定材料基础(图6).

1:Protein Maker;2:Input:MCF7 cell lysis;3:对照组GST Pull down 洗脱产物;4:对照组 GST Pull down 上清;5:实验组GST-FOXA1-C Pull down洗脱产物;6:实验组GST-FOXA1-C洗脱上清;7:GST-FOXA1-C蛋白;8:GST蛋白

图6GST-FOXA1-C融合蛋白

Pull down结果的考马斯亮蓝分析

Fig.6GST-FOXA1-C fusion protein Pull down

analysis of SDS-PAGE of the product

3讨论

GST Pull down技术是体外确定两个已知蛋白是否相互作用以及筛选与已知融合蛋白相互作用的未知蛋白的有效方法. 本实验成功构建GST-FOXA1结构域蛋白的表达载体,这种构建基因的某一段的结构域蛋白研究其生物功能并不少见,有文章报道过构建转录因子FOXO基因的结构域蛋白研究它与目的蛋白的甲基化作用[10].再摸索诱导条件后以比较优化的条件诱导出GST-FOXA1-C和GST-FOXA1-N融合蛋白,作为后续试验的诱饵蛋白.将高表达V5-TLE3的MCF7细胞裂解液中与GST-FOXA1-C诱饵蛋白以最佳时间孵育后,成功捕捉与其已知的结合蛋白TLE3,证实实验制备的融合蛋白具有生物活性.随后再次在MCF7裂解中以GST-FOXA1-C为诱饵蛋白进行GST Pull down,将产物进行SDS-PAGE后考马斯亮蓝染色发现成功捕捉到相互作用的蛋白.

FoxA1是Fox转录因子家族中的一员,该转录因子属于“螺旋-转角-螺旋”类蛋白的一个亚群.Fox家族蛋白功能涉及胚胎发育、细胞周期调控、糖类和脂类代谢、生物老化、免疫调节等多种生物学过程, 其突变和表达异常与发育畸形、代谢性疾病以及肿瘤发生有关[11-12].已有文章得出结论FOXA1与TLE3在乳腺癌中相互作用,本文通过进行GST Pull down成功验证这一结论并证实制备的蛋白具有生物活性.

TLE基因最早在1968年被发现,现已知的家族成员共有19个[13],是典型的转录辅助抑制因子家族蛋白.在哺乳动物中,它包括TLE(transducin-like enhancer of split)1~4(人类).Gro / TLE蛋白家族不能直接与DNA结合,而是被各种不同类型的转录因子所招募[14].有研究证实转录因子FOXA1 羧基端的转录激活区可以招TLE3/GRG3结合到染色质上.本实验通过利用GST-FOXA1-C与TLE3的体外相互作用验证两者相互作用.

乳腺癌现已成为人类的一大杀手,越来越多的研究证明FOXA1在乳腺癌中发挥了重要的作用,使其有望成为肿瘤治疗的新靶点[15-16].本文成功克隆了人的FOXA1,FOXA1-C,FOXA1-N基因并获得有活性的人FOXA1-C和FOXA1-N蛋白,为后续进一步寻找FOXA1的互作蛋白和制备抗体奠定了良好的基础.

参考文献

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Prokaryotic Expression, Purification, and Protein-interaction Analysis of Human FOXA1 Protein

TAN Yong-jun†,CHEN Zhu-lin,CHEN Tuan-hui,XIANG Qin

(College of Biology,Hunan Univ,Changsha,Hunan410082,China)

Abstract:To identify proteins interacting with transcription factor FOXA1,different prokaryotic expression vectors for human FOXA1 protein were constructed and the proteins of FOXA1 C-terminus and FOXA1 N-terminus were purified. They provided a material foundation for future studies of FOXA1-interacted proteins. Total RNAs were extracted from human breast cancer MCF7 cells and reverse transcribed into cDNAs. The full length cDNA of FOXA1 was amplified by PCR, and the C-terminal and N terminal segments were also amplified respectively. The different FOXA1 cDNA fragments were cloned into a prokaryotic expression vector pGEX-4T-1. The correct vectors were confirmed by double restriction enzyme digestion and DNA sequencing and transformed into E. coli BL21 Rosetta DE3. The FOXA1 proteins were purified with Glutathione Sepharose 4B and analyzed through SDS-PAGE electrophoresis and Western blot. GST Pull-down experiments were performed with lysates of MCF7 cells and FOXA1 proteins to test the interaction between FOXA1 and a known FOXA1-interacted protein TLE3.Prokaryotic expression vectors of pGEX-4T-1-FOXA1-C and pGEX-4T-1-FOXA1-N were constructed successfully. The proteins of FOXA1 C-terminus (GST-FOXA1-C) and FOXA1 N-terminus (GST-FOXA1-N) were purified by Glutathione Sepharose 4B. It was confirmed that the purified GST-FOXA1-C was able to interact with the known FOXA1-interacted protein TLE3 in the Pull-down experiment.

Key words:transcrition factor FOXA1; prokaryotic expression; interaction protein

文章编号:1674-2974(2016)06-0104-05

收稿日期:2015-08-16

基金项目:国家自然科学基金资助项目(81472718),National Natural Science Foundation of China(81472718)

作者简介:谭拥军(1967-),男,湖南长沙人,湖南大学教授,博士生导师 †通讯联系人,E-mail:yjtan@hnu.edu.cn

中图分类号:Q786

文献标识码:A

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