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独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼TRPV1基因的克隆及低温适应功能检测

2016-07-15王桂志许强华

大连海洋大学学报 2016年2期

王桂志,张 永, 张 弛,许强华、2、3、4、5

(1.上海海洋大学海洋科学学院,上海201306;2.大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室,上海201306;3.农业部大洋渔业资源环境科学观测试验站,上海201306;4.国家远洋渔业工程技术研究中心,上海201306;5.远洋渔业协同创新中心,上海201306)



独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼TRPV1基因的克隆及低温适应功能检测

王桂志1,张永1, 张弛1,许强华1、2、3、4、5

(1.上海海洋大学海洋科学学院,上海201306;2.大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室,上海201306;3.农业部大洋渔业资源环境科学观测试验站,上海201306;4.国家远洋渔业工程技术研究中心,上海201306;5.远洋渔业协同创新中心,上海201306)

摘要:为从细胞水平上研究独角雪冰鱼Chionodraco hamatus和伯氏肩孔南极鱼Trematomus bernacchii的低温适应能力,采用RT-PCR方法,获得独角雪冰鱼和伯氏肩孔南极鱼的瞬时受体电位阳离子通道蛋白(transient receptor potential channels V1,TRPV1)基因序列,其开放阅读框全长均为2310 bp;生物信息学分析表明,两种南极鱼TRPV1基因均编码769氨基酸残基,预测其蛋白相对分子质量分别为88 210和88 160,理论等电点分别为7.63和8.26;两种南极鱼TRPV1蛋白均无信号肽;亚细胞定位显示,TRPV1蛋白主要在细胞膜和内质网中发挥生物学功能;理化性质分析表明,两种南极鱼的TRPV1为不溶性跨膜蛋白,分别有34、35个磷酸化位点和6、5个糖基化位点,二者均含有6个跨膜结构域、5个锚蛋白结构域,二级结构以随机卷曲为主;同源性分析显示,独角雪冰鱼TRPV1氨基酸序列与伯氏肩孔南极鱼的一致性最高,为93.4%,与其他物种的一致性为44.3%~69.8%;低温适应试验结果显示,两种南极鱼的TRPV1基因不能被温度所激活。……

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