山羊STAT3基因克隆、生物信息学分析及甲基化修饰研究
2016-07-12贾文超刘亮亮吴贤锋赵钊艳
贾文超,刘亮亮,吴贤锋,赵钊艳,王 珂,王 毛,高 静,
王立强1,陈 宏1,潘传英1,蓝贤勇1*
(1.西北农林科技大学 动物科技学院/生命科学学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌 712100;2.江苏科技大学 计算机科学与工程学院,镇江 212003)
山羊STAT3基因克隆、生物信息学分析及甲基化修饰研究
贾文超1#,刘亮亮2#,吴贤锋1,赵钊艳1,王珂1,王毛1,高静1,
王立强1,陈宏1,潘传英1,蓝贤勇1*
(1.西北农林科技大学 动物科技学院/生命科学学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,杨凌 712100;2.江苏科技大学 计算机科学与工程学院,镇江 212003)
摘要:本研究利用RT-PCR、TA克隆和重亚硫酸盐测序(BSP)等方法,旨在克隆、分析山羊STAT3基因完整编码区,并解析该基因甲基化修饰水平及其与体重的关系。结果表明,山羊STAT3基因编码区全长2 313 bp,编码770个氨基酸;与绵羊、牛、野猪、小鼠、大鼠和人的氨基酸序列一致性分别为99.7%、99.6%、99.4%、99.2%、99.4%和99.5%。山羊高体重组与低体重组之间甲基化差异研究发现,高体重组STAT3基因启动子区甲基化水平显著高于低体重组(P=0.020),提示该基因甲基化修饰对体重具有显著影响,可作为标记辅助选择(MAS)的有效表观遗传标记。这些结果为研究山羊肉用性能的遗传与表观遗传机制提供了科学资料。
关键词:山羊;STAT3基因;分子克隆;序列分析;DNA甲基化
羊肉较猪肉更细嫩,而且脂肪与胆固醇含量更少,为此,近年来,羊肉越来越受到消费者的青睐。当前,进一步提升山羊产肉性能已成为现代养羊业发展的关键问题,故对山羊产肉调控机制进行研究显得极其重要。……
