胰岛素样生长因子受体Ⅰ序列结构的生物信息学分析
2016-07-04麦秀英李萍徐柳
麦秀英,李萍,徐柳
西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都 610031
胰岛素样生长因子受体Ⅰ序列结构的生物信息学分析
麦秀英,李萍,徐柳
西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都 610031
麦秀英, 李萍, 徐柳. 胰岛素样生长因子受体Ⅰ序列结构的生物信息学分析. 生物工程学报, 2016, 32(5): 693–701.
Mai XY, Li P, Xu L. Bioinformatics analysis of sequence and structure of insulin-like growth factor-I receptor. Chin J Biotech, 2016, 32(5): 693–701.
摘 要:胰岛素样生长因子受体Ⅰ的 3'UTR长度大于7 kb,结构复杂,有多种miRNAs的结合位点,参与信号通路中MAPK及PI3K/AKT的调节和多种肿瘤的形成和发展,通过生物信息学分析知道其结构特点,为后续研究提供思路。分析表明儿童神经胶质瘤中IGF1R的3'UTR与miRNAs结合位点突变率最高。分析IGF1R序列3'UTR的结构,miRNAs结合位点,氨基酸序列的理化性质,亲疏水性,糖基化和磷酸化位点,二级结构和三级结构建模。IGF1R三级结构与配体IGF1的三级结构模拟分子对接,得到2种蛋白相互作用的氨基酸位置及名称。因此,通过对IGF1R 3'UTR突变,降低与miRNAs的结合,IGF1R表达上调,同时改变与IGF1的氨基酸结合位点,降低2种蛋白的相互作用,从而抑制IGF1R的作用。
关键词:胰岛素样生长因子受体I,序列分析,三维建模,分子对接
Received: August 25, 2015; Accepted: October 19, 2015
Supported by: Scientific Research Foundation for the Returned Overseas Chinese Scholars, State Education Ministry (No. 2013S03008), National Natural Science Foundation of China (No. 31500276).
教育部留学回国人员科研启动基金 (No. 2013S03008),国家自然科学基金 (No. 31500276) 资助。
胰岛素样生长因子受体Ⅰ (Insulin-like growth factor-I receptor,IGF1R) 是酪氨酸蛋白激酶类受体家族的主要成员之一,存在于多种细胞表面,它调控的Raf-MEK-ERK和AKT-mTOR-S6K信号通路对于肿瘤细胞的增殖、分化和转移过程起着重要的作用[1]。大量流行病学和临床病理学实验结果表明,IGF1R在结肠癌、乳腺癌、肺癌、前列腺癌、恶性黑色素瘤、小细胞肺癌和……
