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利用SSR荧光标记毛细管电泳法检测蝴蝶兰组培突变体

2016-05-30肖文芳李佐陈和明吕复兵

热带作物学报 2016年10期

肖文芳 李佐 陈和明 吕复兵

摘 要 以8份蝴蝶兰种质资源为材料,使用SSR标记进行蝴蝶兰种质资源和突变体的鉴定。从25对SSR荧光标记引物中筛选出10对扩增效果理想的SSR荧光标记引物,鉴定4个不同品种的蝴蝶兰及其相应的突变体。10对SSR引物中有9对引物在这8个种质中能扩增出多态性条带,共扩增出38个等位基因,利用其中3对引物SSR3+SSR8+SSR9的组合即可将4个品种及其突变体全部区分开,说明SSR荧光标记毛细管电泳法检测蝴蝶兰突变体高效可行。

关键词 蝴蝶兰;组培突变体;SSR

中图分类号 S682.31 文献标识码 A

Abstract In this research, four Phalaenopsis germplasms and their somaclonal mutants were used to identity mutants by fluorescent labeled simple sequence repeat(SSR)markers. Ten of 25 SSR primer pairs with good repeatability were selected,and then were labeled with fluorescent for amplification and capillary electrophoresis. Nine of 10 SSR primer pairs with high polymorphisms totally amplified 38 polymorphic alleles. SSR3, SSR8 and SSR9 could distinguish all of the samples. The present results provide valuable tools for the cultivar classification and somaclonal variation detection of Phalaenopsis.

Key Words Phalaenopsis; Somaclonal variation; SSR

doi 10.3969/j.issn.1000-2561.2016.10.015

微卫星(Microsatellite),也称为短串联重复序列(short tandem repeats, STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats, SSRs),是指以几个核苷酸(2~5个)为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列。微卫星广泛分布于真核生物整个基因组的不同位置上,由于重复次数的不同及重复程度的不完全造成了每个位点的多态性。SSR具有信息含量高、呈共显性遗传,检测时DNA用量少、操作简便、多态性高、重复性好等特点,是分析种质资源遗传多样性,进行基因组作图的重要手段。传统的SSR检测方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加放射显影或银染的方法,费时费力低效。目前广泛采用的毛细管电泳技术,其原理是利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测,结合分子量内标进行DNA片段长度计算,使SSR分型变得高效快捷,重复性好,结果也更加精确。

SSR在兰科植物上的应用不多,主要集中在种质遗传多样性和亲缘关系的分析上[1-5]。

目前,国际植物新品……

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