钟淦彬 李维国 位明明 郑学项 易晓洁

摘 要 选用178份巴西橡胶树种质材料，采用SSR和AFLP分子标记技术对巴西橡胶树种质资源进行鉴定，探讨2种方法的应用效果并加以比较分析。结果显示：利用多态性强的19对SSR引物，检测到92个等位基因；用25对AFLP引物组，检测到702条有多态性的带。SSR位点的平均多态性信息量（PIC）值为0.46，而AFLP多态性带比例是54.88%，AFLP比SSR分子标记具有更高的多态性。结果说明，AFLP标记比SSR标记更适合于巴西橡胶树种质材料的鉴定和保护，同时进一步验证了在作物遗传资源的研究中，采用多种分子标记方法可以获得更加准确的研究数据。

关键词 巴西橡胶树；SSR；AFLP；分析比较

中图分类号 S794.1 文献标识码 A

Abstract The 178 rubber tree germplasm resources were identified using SSR and AFLP markers and to explore the application effects of two methods by comparing the result of two markers. The results showed that 19 pairs of SSR primers， total 92 polymorphic fragments were detected； 25 AFLP primer combinations（Ecor I/Mse I）were used， and total 701 polymorphic bands were produced. AFLP was higher polymorphic than SSR. The average of polymorphic information content（PIC）was 0.46 for SSRs. Percentage of polymorphic AFLP bands was 54.88%. According to the comparative result acquired in this study， AFLP is more suitable for rubber tree germplasm materials identification and protection than SSR. Meanwhile further validated that in crop genetic resources research， use more kinds of molecular marker method can obtain more accurate data.

Key words Hevea brasiliensis； SSR； AFLP； Comparative analysis

doi 10.3969/j.issn.1000-2561.2016.10.002

20世纪90年代以来，基于PCR技术的分子标记逐步发展起来，如SSR、AFLP等，被广泛应用于动植物种质资源研究。SSR（Simple Sequence Repeats）简单重复序列，最常见是双核苷酸重复，由于串联数目的不同产生其高度的多态性，也称微卫星DNA。SSR检测所需DNA量少，试验操作简便，稳定性好[1]。AFLP（Amplified Fragment Length Polymorphism）扩增片段长度多态性，1992年荷兰Keygene公司科学家Zabeau Mare和Vos Pieter发明并发展起来的一种分子标记方法，是基于PCR技术扩增基因组DNA限制性片段。其重复性强，可靠性好，可信度高，虽然实验成本较高，但也越来越广泛地应用在遗传育种研究领域。进入21世纪以来，分子标记也逐步被应用在橡胶树种资资源的研究中，Saha等[2]用（hmct5、hmct1、hmac4、hmac5）4个SSR标记鉴定了27份橡胶树种质；谢黎黎等[3]用SSR标记构建了87份橡胶树材料的DNA指纹图谱；2007年，王惠君[4]构建了橡胶树初级分子遗传图谱；2010年，龙青姨[5]利用EST～SSR标记研究橡胶树栽培种质的遗传多样性与遗传分化，钟淦彬[6]利用AFLP分子标记方法构建了部分橡胶树种质资源的AFLP指纹图谱。……