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流体剪切力对内皮细胞miR-21和miR-199a表达的影响

2016-04-26王玉彩刘振东赵颖馨

生物信息学 2016年1期
关键词:表达

张 燕,王玉彩,刘振东,赵颖馨,张 华

(1.山东省医学科学院基础医学研究所, 济南 250062;

2.济南大学,山东省医学科学院医学与生命科学学院, 济南 250022;

3.山东省齐河县人民医院,山东齐河 251100)



流体剪切力对内皮细胞miR-21和miR-199a表达的影响

张燕1,2,3,王玉彩3,刘振东1*,赵颖馨1,张华1

(1.山东省医学科学院基础医学研究所, 济南 250062;

2.济南大学,山东省医学科学院医学与生命科学学院, 济南 250022;

3.山东省齐河县人民医院,山东齐河 251100)

摘要:为探讨流体剪切力对内皮细胞micorRNAs表达的影响。采用旋转锥形圆盘剪切力系统对内皮细胞分别加载低(4 dyn/cm2)、中(10 dyn/cm2)和高(15 dyn/cm2)3种不同梯度的剪切力作用24h。对照组未加载剪切力。采用高通量筛选芯片检测microRNAs表达变化,qRT-PCR验证,并进行生物信息学分析。与对照组比较,低剪切力组表达差异的microRNAs有33个(FC>1.5或<0.5倍,P<0.05),其中28个上调,5个下调;中剪切力组表达差异的microRNAs有8个(FC>1.5或<0.5倍,P<0.05),其中6个上调,2个下调;高剪切力组表达差异的microRNAs有31个(FC>1.5或<0.5倍,P<0.05),其中25个上调,6个下调。miR-21在高剪切力组中上调最显著(FC = 0.026), 在低剪切力组中显著下调(FC = 3.531)。miR-199a在低剪切力组中上调最显著(FC = 0.075),在高剪切力组中显著下调(FC = 3.031)。表达差异的microRNA的靶基因主要与内皮细胞的力学信号转导、细胞跨膜迁移、钙离子信号通路、细胞内吞作用等相关。流体剪切力可诱导内皮细胞miR-21和miR-199a表达发生改变。

关键词:剪切力;内皮细胞;microRNA;表达

血管内皮细胞(Endothelial cell, EC)是连接血流和血管壁的重要结构,是血流剪切力(Shear stress, SS)作用的靶细胞,其功能障碍是导致动脉粥样硬化形成的关键因素。研究表明[1-3],不同梯度的血流剪切力对内皮细胞的影响不同。microRNA是一类高度保守、内源性非蛋白编码小分子RNA,参与调节细胞分化、增殖、凋亡、代谢以及多种生物组织生长发育的重要过程[4],并且在机械生物力调节血管细胞生物学效应中也发挥着不可或缺的作用[5-6]。但目前,血流剪切力对内皮细胞microRNA表达的影响仍不清楚。本研究旨在通过高通量芯片筛选技术,探讨剪切力对内皮细胞microRNA表达的影响。

1材料和方法

1.1主要材料

人脐静脉内皮……

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