基于线粒体COI序列探讨安徽长江流域黄鳝群体遗传分化
2016-03-22胡玉婷潘庭双段国庆安徽省农业科学院水产研究所合肥230031
胡玉婷,江 河,潘庭双,凌 俊,段国庆(安徽省农业科学院水产研究所,合肥 230031)
基于线粒体COI序列探讨安徽长江流域黄鳝群体遗传分化
胡玉婷,江河*,潘庭双,凌俊,段国庆
(安徽省农业科学院水产研究所,合肥230031)
摘要:探讨安徽长江流域黄鳝群体遗传结构,采用线粒体COI的DNA条形码序列研究该区6个黄鳝野生群体(当涂、无为、繁昌、贵池、怀宁和望江)遗传分化。180个样本COI片段(665 bp)中共检出52个变异位点(变异率7.8%)、40种单倍型。序列中A、T、G、C碱基平均含量分别为24.7%、28.2%、17.1%、30.0%,A+T含量大于G+C含量。AMOVA分析中,高达68.45%遗传变异来自群体间,说明黄鳝群体间已产生显著遗传分化。群体间系统进化树显示:6个群体形成两大类群(当涂和繁昌群体为一类群,其余群体为另一类群),分析表明结果与各群体地理位置密切相关。同时由NCBI下载合鳃鱼科几个物种的COI同源序列,构建系统进化树,显示黄鳝与同属的山黄鳝聚为一支,并与不同属的合鳃鱼和穴栖蛇胸鳝聚为一支。研究表明,基于COI的DNA条形码序列适于黄鳝群体遗传结构研究。
关键词:黄鳝;COI条形码;遗传分化;长江
胡玉婷,江河,潘庭双,等.基于线粒体COI序列探讨安徽长江流域黄鳝群体遗传分化[J].东北农业大学学报, 2016, 47(2): 74-80. Hu Yuting, Jiang He, Pan Tingshuang, et al. Genetic differentiation of Monopterus albus populations from Anhui Province in Yangtze River basin based on mitochondrial COI barcode sequence[J]. Journal of Northeast Agricultural University, 2016, 47 (2): 74-80. (in Chinese with English abstract)
黄鳝(Monopterus albus)隶属合鳃鱼目(Synbranchiformes)合鳃鱼科(Synbranchidae)黄鳝属,适宜生长在泥塘、沟渠和稻田等缓流浅水中,广泛分布于我国中东部地区淡水水域。黄鳝具有重要营养和药用价值,市场需求大,是我国重要淡水经济鱼类之一,人工养殖已在长江中下游地区广泛开展。段国庆研究表明,随养殖规模扩大和环境污染加剧,黄鳝野生资源越来越少,且出现种质退化和遗传多样性降低等问题[1]。……
