民猪NUMB基因克隆与组织表达分析
2016-03-21王鑫鑫张冬杰东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨50030黑龙江省农业科学院畜牧研究所哈尔滨50086
刘 娣,王鑫鑫,别 墅,张冬杰,汪 亮,李 苓,曹 越(.东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 50030;.黑龙江省农业科学院畜牧研究所,哈尔滨 50086)
民猪NUMB基因克隆与组织表达分析
刘娣1,2,王鑫鑫1,别墅1,张冬杰2,汪亮2,李苓1,曹越1
(1.东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨150030;2.黑龙江省农业科学院畜牧研究所,哈尔滨150086)
摘要:研究采用RT-PCR技术结合克隆测序方法,克隆出全长2 004 bp NUMB基因序列,其中包括1 782 bp开放读码框,该基因编码592个氨基酸。利用生物信息学分析软件对该基因氨基酸序列预测与分析发现:NUMB蛋白二级结构中,转角占很大比例,且蛋白亲水性较强,结构功能域分析发现该蛋白多肽链存在一个N端磷酸酪氨酸结构域(PTB),位于第37~162氨基酸之间。基于不同物种NUMB蛋白序列所构建分子进化树表明,猪与牛、骆驼亲缘关系最近,而与斑马鱼最远。在mRNA水平上,NUMB基因肺中表达量最高,大肠中表达量最低。
关键词:民猪;NUMB基因;反转录PCR;克隆;生物信息学
刘娣,王鑫鑫,别墅,等.民猪NUMB基因克隆与组织表达分析[J].东北农业大学学报, 2016, 47(1): 51-57.
Liu Di, Wang Xinxin, Bie Shu, et al. Cloning and tissue expression analysis of Min pig NUMB gene[J]. Journal of Northeast Agricultural University, 2016, 47(1): 51-57. (in Chinese with English abstract)
细胞命运决定因子NUMB是一种膜相关蛋白,在进化上相对保守。最先在果蝇神经系统中被发现[1],随后在多个哺乳动物体内发现该基因存在,并称为mNUMB基因[2]。该基因一般具有两个保守结构,一个是磷酸酪氨酸结构(PTB),一个是羧基端结构(PRR),这两个结构可分别与LDAP⁃NY、α衔接蛋白和E3泛素激酶等多种蛋白相互作用,行使不同生物学功能[3]。其在细胞不对称分裂、内吞、生长、粘附、迁移等过程中发挥作用,并通过Notch和P53等信号途径决定细胞命运[4-6]。……
