吴 欣, 沈和定, 王冬凤, 刘 宸, 杨铁柱, 刁 亚

(上海海洋大学 省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室, 上海 201306)

石磺是软体动物门(Mollusca) 、腹足纲(Gastropoda) 、肺螺亚纲(Pulmonata)、石磺总科(Onchidioidea) 、石磺科(Onchidiidae)的一群贝类, 主要分布于热带或亚热带地区的海岸、滩涂、岩礁、红树林、潮间带地区, 是海洋与陆地的过渡带生物[1-2]。我国的石磺主要分布在东南沿海的潮间带高潮区, 已报道易采集的主要有4种, 包括瘤背石磺(Onchidium struma)、平疣桑葚石磺(Platevindex mortoni)、紫色疣石磺(Peronia verruculata)、里氏拟石磺(Paraoncidium reevesii), 学者对于石磺的研究主要集中在瘤背石磺,对后3种研究报道较少。其中, 里氏拟石磺的研究主要集中在形态学[1-3]、化学成分测定[4-6]、线粒体基因组及群体多样性的分析[7-9]几个方面, 未见利用分子标记研究其遗传多样性的报道。

微卫星, 又称简单重复序列(SSR)[10], 具有高稳定性、高多态性、引物通用性、位点特异性、检测方便和呈共显性遗传等特点, 在水产动物中主要用于遗传连锁图谱的制备、性状分析、QTL 定位、群体遗传学、进化遗传、种质鉴定与亲权分析, 品种培育等方面[11]。里氏拟石磺作为海洋向陆地进化的过渡物种之一, 在研究海洋无脊椎动物向陆地辐射进化中具有重要作用[12-13], 本研究利用 Illumina HiseqTM 2000高通量转录组测序对里氏拟石磺进行微卫星(SSR)分子标记开发, 为研究其群体遗传学和石磺科不同种贝类间的系统发生提供基础数据。

1 材料和方法

1.1 实验材料

实验材料于2015年5月采自广东湛江海滩, 共37个, 样本经鉴定后均保存于 95%无水乙醇并置于–20℃冰箱中备用。……