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中华绒螯蟹两种微卫星DNA分型方法的应用比较

2015-03-21吴旭干董鹏生成永旭

生物学杂志 2015年1期
关键词:检测

刘 皓, 刘 青, 吴旭干, 何 杰, 董鹏生, 成永旭

(1. 上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点试验室,上海 201306;2. 上海海洋大学 上海高校知识服务平台水产动物遗传育种中心,上海 201306)

中华绒螯蟹两种微卫星DNA分型方法的应用比较

刘 皓1, 2, 刘 青1, 吴旭干1, 何 杰1, 董鹏生1, 成永旭1, 2

(1. 上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点试验室,上海 201306;2. 上海海洋大学 上海高校知识服务平台水产动物遗传育种中心,上海 201306)

为对比荧光标记毛细管电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳在微卫星等位基因分型上的效果,试验选择6对微卫星引物,对60个中华绒螯蟹个体基因组DNA进行PCR扩增,荧光标记法共检测出等位基因129个,平均每个位点21.5个等位变异,聚丙烯酰胺凝胶电泳共检测出等位基因174个,平均每个位点29个等位变异。对位点Esin67的PCR产物分别进行重复检测,发现荧光标记法的重复率为100%,而聚丙烯酰胺凝电泳法两次结果存在较大差异,证实了荧光标记法检测的可靠性显著高于聚丙烯酰胺凝胶电泳。对两种方法的检测效率和经济成本的分析表明,荧光标记法虽然成本较高,但效率高于聚丙烯酰胺凝胶电泳法。建立单重PCR的多重毛细管电泳技术是提高效率、降低成本的有效途径。

中华绒螯蟹;微卫星;PAGE;荧光标记;等位基因

微卫星又称为简单序列重复(Simple Sequence Repeat,SSR)或简单序列长度多态(Simple Sequence Length Polymorphism,SSLP)或短串联重复(Short Tandem Repeats,STR)。微卫星标记作为一种较为理想的分子标记,早在1994年联合国粮农组织(FAO)在其持续发展和管理动物遗传资源的战略计划中, 就将SSR标记作为优先推荐的分析工具[1]。……

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