舒欢欢， 郑伟贤， 钱云霞

(宁波大学 海洋学院 应用海洋生物技术教育部重点实验室， 浙江 宁波 315211)

鲈鱼ZnT基因的cDNA克隆及生物信息学分析

舒欢欢， 郑伟贤， 钱云霞

(宁波大学 海洋学院 应用海洋生物技术教育部重点实验室， 浙江 宁波 315211)

锌转运蛋白(zinc transporters, ZnT)在细胞锌的储藏，释放和分布中起了重要的作用。运用RT-PCR和SMART RACE方法从鲈鱼肝脏克隆得到了鲈鱼ZnT基因全长cDNA序列。结果显示，鲈鱼ZnT全长为1747 bp，包括5′非翻译区84 bp，3′非翻译区490 bp，开放阅读框1173 bp，可编码390个氨基酸。生物信息学分析表明该蛋白有6次跨膜结构，N端和C端均位于细胞膜内侧，第IV和第V跨膜区之间的环富含组氨酸。鲈鱼ZnT的氨基酸序列与其他生物的ZnT7序列有高度的相似性：斑马鱼，85.6%；大西洋鲑，85.4%；红鳍东方鲀，84.3%；人，75.1%；小鼠，73.8%。聚类分析显示鲈鱼ZnT首先与其它鱼类和人ZnT7成一簇，再与鱼的其他类别ZnT聚合，说明分离到的鲈鱼ZnT为ZnT7。

鲈鱼; ZnT; 克隆

锌是生物体必需微量元素，参与了细胞内许多不同的代谢过程。首先，锌作为多种酶的辅助因子参与机体的生理生化反应；其次，锌通过锌指机构域而调节DNA复制，RNA转录以及基因的表达等作用；另外，锌还可以作为功能成分稳定跨膜蛋白的结构等，因此细胞内锌的稳定和平衡对机体非常关键[1-3]。锌在细胞的平衡主要由细胞膜和细胞器中两大类锌转运蛋白(zinc transporters)的活力决定。一类是Slc30(solute-linked carrier 30)基因编码的锌转运蛋白家族(zinc transporter family, ZnT)，也叫阳离子扩助蛋白 (cation diffusion facilitator, CDF)家族；另一类是SLC39(solute-linked carrier 39)基因编码的ZRT/IRT类似蛋白(ZRT/IRT-like protein，ZIP)家族[2-3]。ZnT的作用是通过将锌从胞内运送到胞外空间或运入至细胞器从而降低胞内锌的含量，而ZIP家族的作用则相反，当胞浆内锌含量低时将锌从细胞器运入胞内而提高胞内锌含量[2-3]。……