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麻核桃遗传多样性的SSR分析

2015-03-09贾建云等

山东农业科学 2014年1期
关键词:遗传多样性

贾建云等

摘要:本试验利用SSR标记技术对20个麻核桃品种的遗传多样性进行研究。从12对引物中筛选出6对用于正式PCR扩增,共检测到52个遗传位点,其中多态性遗传位点50个,多态位点百分率为96%。遗传相似性分析结果显示麻核桃种质间具有丰富的遗传多样性,遗传相似系数变幅为0.17~0.90,说明SSR标记能将20份种质完全区分开。UPGMA聚类结果显示,供试材料在相似系数为0.61处聚为4类。

关键词:麻核桃;SSR;遗传多样性

中图分类号:Q754文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)01-0015-04

麻核桃(JuglanshopeiensisHu)又称河北核桃[1],原产于河北北部和北京昌平县南口,主要分布于北京西南山区、南口和夏口,河北北部等地。木材优质坚硬,坚果大,壳厚不易开裂,内隔壁发达、骨质,是制作工艺雕刻核桃的主要原料。麻核桃自然群体类型较多,坚果的大小、形状、纹理的起伏及变化等存在较大差异,其种质资源十分丰富,存在许多特异种质。麻核桃与核桃楸的亲缘关系较近,而与普通核桃、黑核桃的亲缘关系较远[2]。

随着分子生物学的发展,分子标记技术逐步应用于多种植物的研究中。其中SSR标记由于具有稳定性好、多态性高、引物特异性强等优点,应用较广泛。在过去的十几年内,SSR标记已用于多种植物分子多样性和亲缘关系的研究,如梨[3]、椰子[4]、桃[5]、甜樱桃[6]和核桃[7]等。我国是世界上核桃属遗传多样性最为丰富的国家之一[8],但目前对我国麻核桃遗传多样性的研究、特异基因的发掘和利用等研究报道较少。本试验利用SSR标记对我国部分麻核桃种质资源进行研究,探讨这些品种间的遗传多样性及亲缘关系,以期为麻核桃种质资源的评价、利用和遗传育种研究提供理论依据。

1材料与方法

1.1试验材料

试验所用20份材料采集于国家果树种质泰安核桃板栗资源圃(表1),按照随机取样、均匀分布的原则采集新鲜幼叶。

3结论与讨论

核桃在我国栽培历史悠久,属同株异花植物,雌雄异熟[12],长期的自然演变和相互授粉,使核桃群体高度杂合、遗传背景复杂,形成了后代丰富的多样性[13]。本研究通过对供试20个麻核桃样品进行SSR标记分析,结果发现样品之间的相似系数均低于0.90,表明SSR标记能将供试样品完全区分开。从分子水平来说,遗传相似系数的变幅越大,说明其遗传分化越大;遗传多样性高,表明遗传背景的复杂及该物种存在的历史长远[14]。供试麻核桃样品间的相似系数在0.17~0.90之间,相似系数的变幅较大,表明这些品种间具有丰富的遗传多样性,遗传背景亦存在很大差异。

聚类结果显示,野核桃和核桃楸类群的W1、W2、W3、W4、W5和W6聚为一类;W7(代号12-46)为新疆核桃的实生后代优系,单独聚为一类;W13样品“陕西官帽”,原产于陕西秦岭山地,既不和核桃分在一组,也不和核桃楸聚在一起,单独聚为一类,对于陕西官帽的分类地位还需要进一步研究;其他12个麻核桃品种均属于麻核桃居群。这一研究结果和Aradhya等[15]采用叶绿体DNA对核桃属植物的进化分析结果基本一致。

参考文献:

[1]

郗荣庭,张毅萍.中国果树志·核桃卷[M].北京:中国林业出版社,1996.

[2]雷玲.河北核桃ISSR分子标记的遗传多样性研究[D].保定:河北农业大学,2010.

[3]YamamotoT,KimuraT,SawamuraY,etal.Simplesequencerepeatsforgeneticanalysisinpear[J].Euphytica,2002,124:129-137.

[4]MeerowAW,WisserRJ,BrownJS,etal.AnalysisofgeneticdiversityandpopulationstructurewithinFloridacoconut(CocosnuciferaL.)germplasmusingmicrosatelliteDNA,withspecialemphasisontheFijiDwarfcultivar[J].Theor.Appl.Genet.,2003,106(4):715-726.

[5]DirlewangerE,CossonP,TavaudM,etal.Developmentofmicrosatellitemarkersinpeach[Prunuspersica(L.)Batsch]andtheiruseingeneticdiversityanalysisinpeachandsweetcherry(PrunusaviumL.)[J].Theor.Appl.Genet.,2002,105(1):127-138.

[6]艾呈祥,刘庆忠,李国田,等.甜樱桃品种SSR指纹图谱的构建[J].山东农业科学,2002,4:8-10.

[7]DangGS,WoesteK,AradhyaMK,etal.Characterizationof14microsatellitemarkersforgeneticanalysisandcultivaridentificationofWalnut[J].J.Amer.Soc.Hort.Sci.,2005,130(3):348-354.

[8]郗荣庭,张毅萍.中国核桃[M].北京:中国林业出版社,1991.

[9]PorebskiS,BaileyLG,BernandR.ModificationofaCTABDNAextractionprotocolforplantscontaininghighpolysaccharideandpolyphenolcomponents[J].PlantMolecularBiologyReporter,1997,15:8-15.

[10]ForoniI,WoesteK,MontiLM,etal.Identificationof‘Sorrentowalnutusingsimplesequencerepeats(SSRs)[J].Genet.Resour.CropEvol.,2007,54:1081-1094.

[11]ForoniI,RaoR,WoesteK,etal.CharacerisationofJuglansregiaL.withSSRmarkersandevaluationofgeneticrelationshipsamongcultivarsandthe‘Sorrentolandrace[J].JournalofHorticulturalScience&Biotechnology,2005,80(1):49-53.

[12]王国安,买买提·艾力,崔卫国,等.孤雌生殖在核桃品种遗传纯化中的应用[J].新疆农业科学,2003,40(2):90-93.

[13]陈新,张士刚,魏海蓉,等.陕西核桃实生居群遗传多样性ISSR分析[J].山东农业科学,2012,44(5):1-4.

[14]艾呈祥,辛力,余贤美,等.樱桃主栽品种的遗传多样性分析[J].园艺学报,2007,34(4):871-876.

[15]AradhyaMK,PotterD,SimonCJ.Origin,evolution,andbiogeographyofJuglans:aphylogeneticperspective[J].ActaHorticulturae,2006,705:85-94.

摘要:本试验利用SSR标记技术对20个麻核桃品种的遗传多样性进行研究。从12对引物中筛选出6对用于正式PCR扩增,共检测到52个遗传位点,其中多态性遗传位点50个,多态位点百分率为96%。遗传相似性分析结果显示麻核桃种质间具有丰富的遗传多样性,遗传相似系数变幅为0.17~0.90,说明SSR标记能将20份种质完全区分开。UPGMA聚类结果显示,供试材料在相似系数为0.61处聚为4类。

关键词:麻核桃;SSR;遗传多样性

中图分类号:Q754文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)01-0015-04

麻核桃(JuglanshopeiensisHu)又称河北核桃[1],原产于河北北部和北京昌平县南口,主要分布于北京西南山区、南口和夏口,河北北部等地。木材优质坚硬,坚果大,壳厚不易开裂,内隔壁发达、骨质,是制作工艺雕刻核桃的主要原料。麻核桃自然群体类型较多,坚果的大小、形状、纹理的起伏及变化等存在较大差异,其种质资源十分丰富,存在许多特异种质。麻核桃与核桃楸的亲缘关系较近,而与普通核桃、黑核桃的亲缘关系较远[2]。

随着分子生物学的发展,分子标记技术逐步应用于多种植物的研究中。其中SSR标记由于具有稳定性好、多态性高、引物特异性强等优点,应用较广泛。在过去的十几年内,SSR标记已用于多种植物分子多样性和亲缘关系的研究,如梨[3]、椰子[4]、桃[5]、甜樱桃[6]和核桃[7]等。我国是世界上核桃属遗传多样性最为丰富的国家之一[8],但目前对我国麻核桃遗传多样性的研究、特异基因的发掘和利用等研究报道较少。本试验利用SSR标记对我国部分麻核桃种质资源进行研究,探讨这些品种间的遗传多样性及亲缘关系,以期为麻核桃种质资源的评价、利用和遗传育种研究提供理论依据。

1材料与方法

1.1试验材料

试验所用20份材料采集于国家果树种质泰安核桃板栗资源圃(表1),按照随机取样、均匀分布的原则采集新鲜幼叶。

3结论与讨论

核桃在我国栽培历史悠久,属同株异花植物,雌雄异熟[12],长期的自然演变和相互授粉,使核桃群体高度杂合、遗传背景复杂,形成了后代丰富的多样性[13]。本研究通过对供试20个麻核桃样品进行SSR标记分析,结果发现样品之间的相似系数均低于0.90,表明SSR标记能将供试样品完全区分开。从分子水平来说,遗传相似系数的变幅越大,说明其遗传分化越大;遗传多样性高,表明遗传背景的复杂及该物种存在的历史长远[14]。供试麻核桃样品间的相似系数在0.17~0.90之间,相似系数的变幅较大,表明这些品种间具有丰富的遗传多样性,遗传背景亦存在很大差异。

聚类结果显示,野核桃和核桃楸类群的W1、W2、W3、W4、W5和W6聚为一类;W7(代号12-46)为新疆核桃的实生后代优系,单独聚为一类;W13样品“陕西官帽”,原产于陕西秦岭山地,既不和核桃分在一组,也不和核桃楸聚在一起,单独聚为一类,对于陕西官帽的分类地位还需要进一步研究;其他12个麻核桃品种均属于麻核桃居群。这一研究结果和Aradhya等[15]采用叶绿体DNA对核桃属植物的进化分析结果基本一致。

参考文献:

[1]

郗荣庭,张毅萍.中国果树志·核桃卷[M].北京:中国林业出版社,1996.

[2]雷玲.河北核桃ISSR分子标记的遗传多样性研究[D].保定:河北农业大学,2010.

[3]YamamotoT,KimuraT,SawamuraY,etal.Simplesequencerepeatsforgeneticanalysisinpear[J].Euphytica,2002,124:129-137.

[4]MeerowAW,WisserRJ,BrownJS,etal.AnalysisofgeneticdiversityandpopulationstructurewithinFloridacoconut(CocosnuciferaL.)germplasmusingmicrosatelliteDNA,withspecialemphasisontheFijiDwarfcultivar[J].Theor.Appl.Genet.,2003,106(4):715-726.

[5]DirlewangerE,CossonP,TavaudM,etal.Developmentofmicrosatellitemarkersinpeach[Prunuspersica(L.)Batsch]andtheiruseingeneticdiversityanalysisinpeachandsweetcherry(PrunusaviumL.)[J].Theor.Appl.Genet.,2002,105(1):127-138.

[6]艾呈祥,刘庆忠,李国田,等.甜樱桃品种SSR指纹图谱的构建[J].山东农业科学,2002,4:8-10.

[7]DangGS,WoesteK,AradhyaMK,etal.Characterizationof14microsatellitemarkersforgeneticanalysisandcultivaridentificationofWalnut[J].J.Amer.Soc.Hort.Sci.,2005,130(3):348-354.

[8]郗荣庭,张毅萍.中国核桃[M].北京:中国林业出版社,1991.

[9]PorebskiS,BaileyLG,BernandR.ModificationofaCTABDNAextractionprotocolforplantscontaininghighpolysaccharideandpolyphenolcomponents[J].PlantMolecularBiologyReporter,1997,15:8-15.

[10]ForoniI,WoesteK,MontiLM,etal.Identificationof‘Sorrentowalnutusingsimplesequencerepeats(SSRs)[J].Genet.Resour.CropEvol.,2007,54:1081-1094.

[11]ForoniI,RaoR,WoesteK,etal.CharacerisationofJuglansregiaL.withSSRmarkersandevaluationofgeneticrelationshipsamongcultivarsandthe‘Sorrentolandrace[J].JournalofHorticulturalScience&Biotechnology,2005,80(1):49-53.

[12]王国安,买买提·艾力,崔卫国,等.孤雌生殖在核桃品种遗传纯化中的应用[J].新疆农业科学,2003,40(2):90-93.

[13]陈新,张士刚,魏海蓉,等.陕西核桃实生居群遗传多样性ISSR分析[J].山东农业科学,2012,44(5):1-4.

[14]艾呈祥,辛力,余贤美,等.樱桃主栽品种的遗传多样性分析[J].园艺学报,2007,34(4):871-876.

[15]AradhyaMK,PotterD,SimonCJ.Origin,evolution,andbiogeographyofJuglans:aphylogeneticperspective[J].ActaHorticulturae,2006,705:85-94.

摘要:本试验利用SSR标记技术对20个麻核桃品种的遗传多样性进行研究。从12对引物中筛选出6对用于正式PCR扩增,共检测到52个遗传位点,其中多态性遗传位点50个,多态位点百分率为96%。遗传相似性分析结果显示麻核桃种质间具有丰富的遗传多样性,遗传相似系数变幅为0.17~0.90,说明SSR标记能将20份种质完全区分开。UPGMA聚类结果显示,供试材料在相似系数为0.61处聚为4类。

关键词:麻核桃;SSR;遗传多样性

中图分类号:Q754文献标识号:A文章编号:1001-4942(2014)01-0015-04

麻核桃(JuglanshopeiensisHu)又称河北核桃[1],原产于河北北部和北京昌平县南口,主要分布于北京西南山区、南口和夏口,河北北部等地。木材优质坚硬,坚果大,壳厚不易开裂,内隔壁发达、骨质,是制作工艺雕刻核桃的主要原料。麻核桃自然群体类型较多,坚果的大小、形状、纹理的起伏及变化等存在较大差异,其种质资源十分丰富,存在许多特异种质。麻核桃与核桃楸的亲缘关系较近,而与普通核桃、黑核桃的亲缘关系较远[2]。

随着分子生物学的发展,分子标记技术逐步应用于多种植物的研究中。其中SSR标记由于具有稳定性好、多态性高、引物特异性强等优点,应用较广泛。在过去的十几年内,SSR标记已用于多种植物分子多样性和亲缘关系的研究,如梨[3]、椰子[4]、桃[5]、甜樱桃[6]和核桃[7]等。我国是世界上核桃属遗传多样性最为丰富的国家之一[8],但目前对我国麻核桃遗传多样性的研究、特异基因的发掘和利用等研究报道较少。本试验利用SSR标记对我国部分麻核桃种质资源进行研究,探讨这些品种间的遗传多样性及亲缘关系,以期为麻核桃种质资源的评价、利用和遗传育种研究提供理论依据。

1材料与方法

1.1试验材料

试验所用20份材料采集于国家果树种质泰安核桃板栗资源圃(表1),按照随机取样、均匀分布的原则采集新鲜幼叶。

3结论与讨论

核桃在我国栽培历史悠久,属同株异花植物,雌雄异熟[12],长期的自然演变和相互授粉,使核桃群体高度杂合、遗传背景复杂,形成了后代丰富的多样性[13]。本研究通过对供试20个麻核桃样品进行SSR标记分析,结果发现样品之间的相似系数均低于0.90,表明SSR标记能将供试样品完全区分开。从分子水平来说,遗传相似系数的变幅越大,说明其遗传分化越大;遗传多样性高,表明遗传背景的复杂及该物种存在的历史长远[14]。供试麻核桃样品间的相似系数在0.17~0.90之间,相似系数的变幅较大,表明这些品种间具有丰富的遗传多样性,遗传背景亦存在很大差异。

聚类结果显示,野核桃和核桃楸类群的W1、W2、W3、W4、W5和W6聚为一类;W7(代号12-46)为新疆核桃的实生后代优系,单独聚为一类;W13样品“陕西官帽”,原产于陕西秦岭山地,既不和核桃分在一组,也不和核桃楸聚在一起,单独聚为一类,对于陕西官帽的分类地位还需要进一步研究;其他12个麻核桃品种均属于麻核桃居群。这一研究结果和Aradhya等[15]采用叶绿体DNA对核桃属植物的进化分析结果基本一致。

参考文献:

[1]

郗荣庭,张毅萍.中国果树志·核桃卷[M].北京:中国林业出版社,1996.

[2]雷玲.河北核桃ISSR分子标记的遗传多样性研究[D].保定:河北农业大学,2010.

[3]YamamotoT,KimuraT,SawamuraY,etal.Simplesequencerepeatsforgeneticanalysisinpear[J].Euphytica,2002,124:129-137.

[4]MeerowAW,WisserRJ,BrownJS,etal.AnalysisofgeneticdiversityandpopulationstructurewithinFloridacoconut(CocosnuciferaL.)germplasmusingmicrosatelliteDNA,withspecialemphasisontheFijiDwarfcultivar[J].Theor.Appl.Genet.,2003,106(4):715-726.

[5]DirlewangerE,CossonP,TavaudM,etal.Developmentofmicrosatellitemarkersinpeach[Prunuspersica(L.)Batsch]andtheiruseingeneticdiversityanalysisinpeachandsweetcherry(PrunusaviumL.)[J].Theor.Appl.Genet.,2002,105(1):127-138.

[6]艾呈祥,刘庆忠,李国田,等.甜樱桃品种SSR指纹图谱的构建[J].山东农业科学,2002,4:8-10.

[7]DangGS,WoesteK,AradhyaMK,etal.Characterizationof14microsatellitemarkersforgeneticanalysisandcultivaridentificationofWalnut[J].J.Amer.Soc.Hort.Sci.,2005,130(3):348-354.

[8]郗荣庭,张毅萍.中国核桃[M].北京:中国林业出版社,1991.

[9]PorebskiS,BaileyLG,BernandR.ModificationofaCTABDNAextractionprotocolforplantscontaininghighpolysaccharideandpolyphenolcomponents[J].PlantMolecularBiologyReporter,1997,15:8-15.

[10]ForoniI,WoesteK,MontiLM,etal.Identificationof‘Sorrentowalnutusingsimplesequencerepeats(SSRs)[J].Genet.Resour.CropEvol.,2007,54:1081-1094.

[11]ForoniI,RaoR,WoesteK,etal.CharacerisationofJuglansregiaL.withSSRmarkersandevaluationofgeneticrelationshipsamongcultivarsandthe‘Sorrentolandrace[J].JournalofHorticulturalScience&Biotechnology,2005,80(1):49-53.

[12]王国安,买买提·艾力,崔卫国,等.孤雌生殖在核桃品种遗传纯化中的应用[J].新疆农业科学,2003,40(2):90-93.

[13]陈新,张士刚,魏海蓉,等.陕西核桃实生居群遗传多样性ISSR分析[J].山东农业科学,2012,44(5):1-4.

[14]艾呈祥,辛力,余贤美,等.樱桃主栽品种的遗传多样性分析[J].园艺学报,2007,34(4):871-876.

[15]AradhyaMK,PotterD,SimonCJ.Origin,evolution,andbiogeographyofJuglans:aphylogeneticperspective[J].ActaHorticulturae,2006,705:85-94.

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