罗志辉 吴 民 赵逸青

(美国威斯康辛大学密尔沃基分校 密尔沃基 53201)



大数据在生物医学信息学中的应用

罗志辉 吴 民 赵逸青

(美国威斯康辛大学密尔沃基分校 密尔沃基 53201)

大数据在生物医学信息学研究中的作用日益重要，介绍大数据在生物信息学、临床医学信息学、影像信息学和公共卫生信息学4个领域的应用，列举并总结一些最近的工作进展，对未来大数据在生物医疗领域的发展进行展望。

大数据； 生物医学信息学；应用

1 引言

随着信息技术在医学临床和科研中的应用，临床医学、生物学、信息学发生了一次交叉融合，形成了生物医学信息学(Biomedical Informatics)。医院信息化的建设、医疗诊断手段的进步和高通量实验设备的利用，使得医学数据呈现几何级数的增长，表现出“大数据”的特征。开展大数据相关研究工作，能更好地发现新知识、提高医疗服务的效率和质量。这种研究技术的应用必将成为生物医药科学技术发展的趋势，也必将是未来生物信息研究领域的核心技术。

2 大数据概述

2.1 大数据

大数据是一种新的研究模式和应用生态系统，它改变了之前以个别案例为基础的研究方式，更多地使用大规模的数据作为研究驱动。大数据量，这是大数据的第1个特点。随着高通量检测技术的发展，现在已进入一个生物信息学数据量呈指数级增长的时代。例如，ProteomicsDB覆盖了Swiss-Prot数据库中注明已知的人类基因的92%(19 629中的18 097，具有5.17 TB的数据量[1])。在临床方面，美国医疗信息……