GPC3特异的siRNA筛选和对肝癌细胞增殖能力的影响
2012-12-20邱志东缪辉来雷长江刘忠考包仕廷
邱志东 缪辉来 雷长江 刘忠考 黎 然 包仕廷
广东医学院附属医院肝胆外科,广东湛江 524001
磷脂酰肌醇蛋白聚糖3(Glypican-3,GPC3)被发现常在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中高表达,在HCC的发生发展中具有重要作用[1-2]。RNA干扰(RNA interference,RNAi)目前是一种成熟的研究基因功能的方法[3],本研究先设计特异靶向GPC3的siRNAs,然后进行筛选,并进一步验证有效抑制GPC3表达后对肝癌细胞增殖能力的影响,以此探讨GPC3在HCC中的作用。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
肝癌细胞Huh7(南方医科大学病理研究所),DMEM、lipofectamine 2000和Trizol(Invitrogen),RT-PCR试剂盒(TaKaRa),SYBR Green PCR Master Mix(Toyobo),GPC3一抗和二抗(Novus Biologicals)。
1.2 细胞培养
Huh7细胞培养于含10%胎牛血清和双抗的高糖DMEM中,置于37℃、含5% CO2的细胞培养箱内培养,用0.25%的胰酶进行消化、传代。
1.3 siRNA设计合成
根据GPC3(Genbank号:NM_001164617)的序列,运用在线设计工具siSearch和sFold设计合成靶向GPC3的siRNA,并交由上海吉玛制药技术有限公司合成,序列如下:

表1 siRNA序列
1.4 siRNA转染
转染前1天,细胞接种6孔板,接种浓度为1×105个细胞/mL,每孔1 mL;第2天当细胞汇合度达到70%左右时进行转染,步骤参考说明书进行,siRNA终浓度设3个梯度为25 nmol(/L·孔)、50 nmol(/L·孔)、75 nmol(/L·孔);4~6 h后,更换完全培养基,72 h后进行后续检测。
1.5 荧光定量PCR检测
收集细胞,加入1 mL Trizol提取总RNA,定量后用1μg RNA进行逆转录,SYBR-Green染料法进行定量PCR,20μL体系含100 ng cDNA。反应条件为:95℃ 5 min;95℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 30 s,40 cycles。每个样做 3个重复,定量分析通过比较 2-ΔΔCt值进行。GPC3 和内参 GAPDH 定量所用引 物 为:GPC3-F:5'-AGAAACCTTATCCAGCCGAAGAA-3’;GPC3-R:5'-TGGGTCCAACTACTAAGCT-3’。GAPDH-F:5'-GGTATCGTGGAAGGACTC-3’;GAPDH-R:5'-GTAGAGGCAGGGATGATG-3’。
1.6 Western Blot
细胞收集后用PBS洗涤2次,加入含蛋白酶抑制剂的RIPA buffer(1X PBS,1% NP-40,0.1% SDS,5 mmol/L EDTA,0.5%脱氧胆酸钠和1 mmol/L正钒酸钠)裂解细胞。蛋白样品定量后,于8% SDS-PAGE上进行分离,并电转至PVDF膜上,用5%脱脂奶粉溶液进行封闭。加入稀释到合适浓度的GPC3和GAPDH一抗,于4℃孵育过夜进行免疫杂交。然后加入HRP标记的抗兔二抗,最后加入West Femto化学发光检测底物(PIERCE)进行反应,显影检测。……
