鸭黄病毒安徽分离株NS5基因部分片段的克隆和序列分析
2012-09-26赵瑞宏胡晓苗张丹俊
戴 银,赵瑞宏,胡晓苗,张丹俊
(安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,安徽合肥230031)
黄病毒属是一群具有包膜的单股正链RNA病毒,是黄病毒科中最大的家族,包括日本脑炎病毒、登革病毒、黄热病毒和丙型肝炎病毒等多种病毒。该病毒大多数可通过吸血的节肢动物,如蚊、蜱等媒介传播[1-2]。2010年以来,我国江苏、山东和浙江等地均报道暴发了一种引起鸭产蛋大幅下降的疾病,给蛋鸭养殖业造成了很大的经济损失[3-4]。部分研究证实,该病主要由造成鸭出血性卵巢炎的黄病毒引起,由于鸭感染该病毒可导致卵巢发育不良,卵泡变性、变形,卵泡膜充血等症状,进而造成产蛋量下降[5]。与此同时,安徽省部分鸭群也发现了类似病症,为调查发病的原因,我们获取了病料,通过分离鉴定,证实为鸭黄病毒感染所致[6]。我们进一步克隆鸭黄病毒安徽分离株NS5基因部分序列,研究其遗传进化特征,为鸭黄病毒病的防控提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料
试验蛋鸭来自安徽省望江养鸭场,具有产蛋期产蛋量突然下降的症状。鸭胚购自肥西县鸭场。Trizol Reagent购自Invitrogen公司;cDNA第一链合成试剂盒、Taq酶、d NTP等试剂,购自宝生物工程(大连)有限公司。通过GenBank数据库获得9条黄病毒科黄病毒属毒株NS5基因的相应序列作为分析样本。
1.2 方法
1.2.1 引物设计 经Oligo6.0软件分析,参照Gen-Bank数据库中登录的黄病毒基因序列(登录号:JQ595407),以及已发表的文献[7],设计一对扩增引物:P1:5′-CTA (T/C)CA (T/C)GGAAG (T/C)TACGAAGT -3′;P2:5′-CTTTTCTCGCTT (T/C)CCCATCAT -3′。
P1、P2预期扩增片段大小为469 bp,扩增的目的片段命名为DFV-NS5-1。引物由宝生物工程(大连)有限公司合成。……
