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皖南地区汉族人群21号染色体上3个STR位点的多态性分析

2012-09-20何淑凤李铁臣

皖南医学院学报 2012年5期

何淑凤,李 慧,李铁臣,孙 青

(1.皖南医学院附属弋矶山医院 妇产科,安徽 芜湖 241001;2.皖南医学院 分子生物学研究室,安徽 芜湖 241002)

唐氏综合征(Down syndrome,DS),也称21三体综合征,是最常见的染色体数目异常性疾病,活婴的发病率为1/1 000~1/800[1],发病机制是由于21号染色体全部或者部分三体所导致的[2],目前尚无理想的治疗方法,主要通过产前筛查和诊断,终止妊娠而降低患儿出生率。传统的细胞遗传学分析技术是确诊21三体的金标准,但孕早期行羊水、绒毛膜穿刺可能会导致流产[3],稍许污染可能导致细胞培养失败[4]以及耗时长等缺点限制了其在临床快速产前诊断中的广泛应用。Bili等[5]研究认为短串联重复序列(short tandem repeat,STR)是定量检测染色体数目异常最合适的遗传标记之一。因此本实验通过毛细血管电泳对STR分型的方法,研究21号染色体上的3个位点的多态性,从而探讨一种更为快速、准确的对DS患者进行STR分型的方法。

1 对象与方法

1.1 DNA标本 100例正常人EDTA抗凝血均来自皖南医学院附属弋矶山医院体检中心2009年2~4月,经体检指标均正常且无血缘关系的汉族个体,其中男性74例,女性26例,年龄16~63岁,平均为(37.82±10.08)岁,常规酚-氯仿抽提DNA,于4℃冰箱保存备用。

1.2 PCR扩增 D21S55(21q22.2)及21q22.3远端被称为DS关键区(down syndrome critical region,DSCR)。选取21号染色体核心区域及其附近的3个STR位点(D21S11、D21S1409和 D21S1414),根据3个STR位点分别设计引物,上游引物5'端分别用FAM荧光标记,引物序列来源于NCBI的UniSTS数据库(http://www.ncbi.n1m.nih.gov/unists/),由上海捷瑞生物工程技术服务有限公司合成,引物序列见表1。

表1 引物序列Tab 1 Primer sequences

反应体系 PCR总反应体积50μl:其中10×Buffer(含 Mg2+)5 μl,dNTP Mixture(10 mM/μl)1 μl,上下游引物各 0.5 μl,模板 DNA 2 μl,Taq 酶(Tiangen公司,2.5 U/μl)1 μl,加双蒸水至总体积50 μl。……

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