HCV分型研究进展
2012-09-05夏雪山胡学伟
李 媛,冯 悦,夏雪山,胡学伟
(昆明理工大学,昆明 650500)
目前丙型肝炎病毒(HCV)感染已成为世界性的公共卫生难题,威胁着人类健康。HCV全球感染人数接近1.7亿,且以每年新增300万的速度增长,具有流行面广、发病率高的特点,并与慢性肝病、肝硬化、肝癌等疾病密切相关[1]。该病毒自1989年首次鉴定以来,经过20多年的研究,对其病毒学等方面的特征已有了较深入的认识。HCV是单股正链的 RNA 病毒,基因组全长约为 9.6 kb[2]。目前,针对HCV通常使用的治疗方法是聚乙二醇干扰素-ɑ(Peg-IFN-ɑ,)联合利巴韦林(RBV),但该方法并非对所有的丙型肝炎(丙肝)患者都有理想的疗效,其中,HCV的基因型及基因亚型是影响疗效的一个主要因素[1,3]。不同的HCV基因型或亚型对肝脏的损伤情况不同,对干扰素的敏感性也有差异,因而在疾病进程、治疗等方面不能从一而论。目前已发现的的 HCV 基因型有6 种,基因亚型 80 余种[4,5],并且新的基因型和亚型仍在不断报道中[6~9]。本文现就目前HCV分型研究中常用的方法、分型区段作一综述。
1 HCV分型常用方法
目前HCV分型中常采用的方法有如下几类:多聚酶链式反应(PCR)及相关衍生方法、血清学方法、基因芯片法等。
1.1 PCR及相关衍生方法 PCR法因其能对微量核酸进行指数倍扩增,并最终获得检测结果,又具有相对快速、高效的特点,得到广泛应用。PCR依赖的序列分析法主要是通过对病毒基因组全长序列或部分序列的测定比对及分析,发现其不同特点,从而进行基因型或亚型的确定。在基本PCR方法的基础上,又衍生出了实时荧光定量 PCR(real-time PCR)、巢式PCR(nested-PCR)、限制性片段长度多态性(RFLP)等方法。……
