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汉坦病毒M、S基因分型及种系进化分析*

2012-01-24高立冬刘运芝胡世雄刘富强刘佳惠李俊华

中国人兽共患病学报 2012年2期
关键词:检测

蔡 亮,张 红,高立冬,刘运芝,胡世雄,刘富强,曾 舸,刘佳惠,李俊华

汉坦病毒M、S基因分型及种系进化分析*

蔡 亮,张 红,高立冬,刘运芝,胡世雄,刘富强,曾 舸,刘佳惠,李俊华

目的探讨湖南省肾综合征出血热(HFRS)患者及宿主动物黑线姬鼠携带汉坦病毒的基因型别及序列特征。方法应用免疫荧光试验(IFA)对鼠肺标本进行粗筛,提取IFA阳性鼠肺组织及HFRS患者血清总RNA,设计汉坦病毒M、S基因特异性引物,应用RT-PCR技术进行扩增,回收阳性扩增产物并克隆到p MD-18 T载体进行序列测定,将所测序列与国内外HTNV及SEOV病毒株序列进行核苷酸同源性分析,应用MEGA5.0.4软件构建M、S基因种系进化树。结果IFA阳性鼠肺标本荧光显微镜下可见散在的黄绿色针尖大小样颗粒;RT-PCR法扩增汉坦病毒M、S基因,HTNV通用引物可见490 bp与593 bp的阳性条带;阳性产物进一步应用HTNV分型引物进行M、S基因检测,分别扩增出一约242 bp与276 bp大小的条带;SEO型特异性M、S基因片段内侧引物扩增反应均为阴性;编号为Hunan01、Hunan02、Hunan03的M、S基因序列与HTNV型84FLi株、SN7株的同源性最高,与SEOV型Gou3株的同源性最低;种系进化分析表明,Hunan01、Hunan02、Hunan03为汉坦病毒H5亚型。结论湖南省存在HTNV型感染病例与宿主动物,基因分型技术能进一步对病毒亚型进行鉴定。

肾综合征出血热;汉坦病毒;M基因;S基因;分型;种系进化

汉坦病毒(Hantavirus,HV)属于布尼亚病毒科(Bunyaviridae)汉坦病毒属,编码L、M、S 3个基因片段[1],目前至少可以分为30个血清型/基因型,一些新的HV属病毒还在不断的发现中,主要引起肾综合征出血热(HFRS)和汉坦病毒肺综合征(HPS),基因组内极易发生变异,全球约90%以上的 HFRS 病 例 发 生 在 中 国[2-4]。……

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