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应用多因子降维法MDR分析基因-基因的交互作用

2012-01-05王娜娜张毓洪

中国老年保健医学 2012年6期
关键词:分析方法模型

王娜娜 张毓洪 杨 泽

交互作用是指两个或多个因素相互发生作用而产生的一种效应。当两个或多个因素共同作用于某一事件,其效应大于或小于各因素共同作用的效应时,可认为因素间存在交互作用,前者称为协同效应(cooperative effect),后者称为拮抗效应(antagonistic effect)。医学研究证实,罕有疾病是纯粹由单一的遗传或者环境因素决定的,尤其是基因-基因交互作用在许多疾病,特别是常见的慢性疾病(高血压、糖尿病、哮喘等)发病中,具有非常重要的意义。

探讨基因-基因交互作用,根据不同个体的遗传因素寻找相互之间可能存在的交互作用,对制定有效的疾病预防控制干预措施,提高群体健康素质具有非常重要的理论研究意义和实用价值;更有效地检测和分析交互作用也是近年一直困扰医学及其关联学科研究与发展的难题。在进行多基因交互作用分析过程中,模型中常常会产生较多的参数,但样本含量相对较少;小样本研究中,由于过度拟合,给统计方法学研究提出了许多新问题,比如众所周知的“维度困扰”。由于每个基因有多个位点,如果统计分析不考虑位点之间的相互作用将会使模型的效能大大降低。交互作用分析时,众多的分类影响因素及其组合会产生高纬度的列联表,这就导致列联表中有些格子的频数为O,出现所谓“空格子"(null cells count)情况,这对交互作用分析提出了新要求,交互作用阶数越高,解释分析问题就越复杂。有关研究交互作用的方法很多,现主要介绍MDR方法。……

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