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浙江汉族人群HLAⅠ类基因多态性初步分析

2011-12-13戴卫健李萌朱发明严力行

中华移植杂志(电子版) 2011年2期
关键词:浙江

戴卫健 李萌 朱发明 严力行

HLA基因具有高度的多态性,在不同地区、不同民族人群中,该基因及单倍型频率分布存在显著的差异。HLA多态性分析有助于提高器官移植供受者间配型成功率[1]。本研究采用PCR测序分型法分析浙江汉族人群HLA-A、B和C位点的等位基因及其单倍型,为非血缘关系器官移植配型、法医鉴定、个体识别等研究积累资料。

1 材料与方法

1.1 材 料

浙江地区健康、无血缘关系的汉族无偿献血者100名,经其知情同意后,采集外周静脉血5 mL,乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝。

1.2 方 法

采用血液基因组DNA抽提试剂盒(PEL-FREEZ公司,美国)进行基因组DNA抽提,严格按试剂说明进行操作。紫外分光光度计和1%琼脂糖凝胶电泳检测样本DNA纯度和浓度,-20℃保存。然后,扩增HLA-A、B和C基因组全长序列,扩增引物由上海英俊生物有限公司合成,引物序列见表1。扩增反应体系为25μL,其中含10×PCR缓冲液2.5μL,DNA模板约100 ng,LA TaqDNA 聚合酶1.0 U,dNTP、氯化镁溶液终浓度分别为0.2 mmol/L和1.25 mmol/L,引物终浓度为0.3μmol/L。扩增条件为95℃预变性5 min;95 ℃ 30 s,67 ℃ 45 s,72 ℃ 30 s,35 个循环;72℃延伸10 min。之后,往每管PCR产物中加入核酸外切酶Ⅰ1μL(2 U)和碱性磷酸酶2μL(10 U)[宝生物工程(大连)有限公司],在9700型PCR自动扩增仪(ABI公司,美国)上进行酶切,37℃ 30 min,80℃ 15 min,以纯化PCR产物。再以纯化PCR产物为模板,按照BigDye测序试剂盒(ABI公司,美国)操作说明进行双向测序,测序引物序列见表2。测序反应条件为95℃预变性5 min;95℃ 30 s,47℃45 s,60℃ 4 min,35个循环;冷却至4℃保存。测序结果采用Assign 3.5软件进行分析。

表1 HLAⅠ类基因PCR扩增引物序列

1.3 统计学分析

基因频率采用直接计数法计算,单倍型频率计算、Hardy-Weinberg检验均采用 ARLEQUIN 2.0软件分析。

表2 HLAⅠ类基因测序引……

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