家畜戊型肝炎病毒诊断方法的建立及应用*
2011-08-21苏乾莲秦毅斌梁家幸肖爱欢段群棚黄伟坚
苏乾莲,李 斌,赵 武,秦毅斌,梁家幸,肖爱欢,段群棚,何 颖,黄伟坚
2.广西大学动物科学技术学院,南宁 530005;
戊型肝炎(Hepatitis E,HE)是由戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)引起的一种经消化道传播的急性病毒性肝炎,呈全球分布,以暴发流行或散发感染的形式存在。其临床和流行病学特点类似甲型肝炎,但主要侵犯青壮年,孕妇感染后病死率可高达20%[1]。1997年,Meng等在美国猪体首次分离到HEV毒株,发现其与美国人源HEV高度相似,并发现其可感染黑猩猩和恒河猴,从而首次证实了HEV种间传播的可能性[2]。随后,陆续在狗、猫、羊、牛、马等与人类密切相关的动物中发现HEV抗体或 RNA,但仍需要进一步深入研究[3-8]。
2007年第12届国际病毒性肝炎和肝病研讨会上,将HEV分为5个基因型,I型和II型仅感染人,III型和IV型为人兽共患,禽HEV被归为戊型肝炎病毒属,暂定为基因V型[9]。在前人研究基础上,本研究建立检测家畜基因I型-IV型HEV通用性RT-nPCR,并对采自广西各地的猪、牛、羊肝粪样本进行HEV检测。
1 材料与方法
1.1 主要试剂 TRIZOL Regent为Invitrogen产;d NTP为上海生工生物工程有限公司产;Ribonuclease Inhibitor为 Ta KaRa产;M-MLV Reverse Transcriptase为 Promega产;Dream TaqTMDNA Polymerase为Fermentas产;Mark1为广州东盛生物科技有限公司产。
1.2 样本和对照品 采集广西地区猪、牛、羊新鲜粪便样本以及各地市场销售或屠宰场新鲜家畜肝脏,尽快检测或-20℃保存备检。戊型肝炎病毒阳性样本由广西大学赠送;猪瘟病毒(CSFV)、伪狂犬病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪细小病毒(PPV)、乙脑病毒(JEV)由本实验室保存;阴性对照为DEPC水。
1.3 引物设计及合成 参考GenBank上4种基因型HEV核苷酸序列,应用生物软件Oligo6.0在ORF2保守区设计……
