LAMP(环介导等温扩增)的原理及在寄生虫检测上的应用*
2011-08-21史亚东赵子方张龙现宁长申菅复春
史亚东,赵子方,朱 丹,张龙现,宁长申,菅复春
LAMP(环介导等温扩增)的原理及在寄生虫检测上的应用*
史亚东,赵子方,朱 丹,张龙现,宁长申,菅复春
2000年,Notomi等[1]建立了一种快速、简单、灵敏、特异并且低成本的核酸扩增方法——环介导等温扩增法(LAMP),这种新颖的核酸扩增方法具有许多优势[2-4]:(1)扩增效率极高,60min内扩增产物可达到靶基因的109~1010倍;(2)操作简单,只需在65℃左右的恒温条件下将反应物混合即可,不需要复杂的温度变化过程;(3)灵敏性高,扩增模板只需10拷贝或更少;(4)特异性高,设计4条引物识别靶基因上6个不同区域;(5)结果判定简单,可以通过反应副产物直接肉眼观察,也可以通过浊度仪实时监控,无需电泳。LAMP方法的这些优势,使其短时间内在病毒、微生物、寄生虫等检测上广泛应用。以下就LAMP方法的原理及在寄生虫检测上的应用,简述如下。
1 LAMP原理[1,5]
1.1 引物 LAMP方法需要根据靶基因设计两对特殊引物,分别是内引物FIP和BIP、外引物F3和B3。它们特异识别靶基因的6个不同区域:3′端的F3c、F2c、F1c和5′端的B1、B2、B3。FIP由F2(与F2c互补)和F1c构成;BIP由B2(与B2c互补)和B1c构成,如图1。

图1 LAMP的引物组成及对应区域
LAMP方法的引物设计较为复杂,但有专门软件可以设计LAMP引物,这使LAMP方法变的很易操作,Eiken GENOME SITE网站(http://primerexplorer.jp/e/)专门开发了 LAMP引物设计软件,研究者可以通过该软件获得精准的LAMP引物。
1.2 循环过程 在65℃左右时,DNA双链处于解链和聚合的动态平衡中,一个LAMP引物可以和靶基因链的一端互补结合,然后开始利用DNA聚合酶通过链置换作用合成DNA,置换并释放出一条单链DNA,这不像PCR方法那样需要通过热变性来得到单链DNA。……
