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利用MLST技术对浙江省大肠杆菌O157的分子流行病学研究*

2011-08-21叶菊莲梅玲玲姚苹苹姜理平

中国人兽共患病学报 2011年10期
关键词:浙江省数据库分析

叶菊莲,占 利,梅玲玲,罗 芸,姚苹苹,姜理平

利用MLST技术对浙江省大肠杆菌O157的分子流行病学研究*

叶菊莲,占 利,梅玲玲,罗 芸,姚苹苹,姜理平

目的 对浙江省2005-2010年大肠杆菌O157分离株进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系,为浙江省大肠杆菌O157监测及爆发疫情的控制提供基础。方法 选择Pasteur大肠杆菌多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing,MLST)方案,对大肠杆菌O157分离株及882364菌株进行 MLST分型,确定菌株序列型(Sequence type,ST);采用DNAsp、eBURST、START2等软件进行分析。结果 30株菌中,27株O157∶H7菌株具备相同序列型(ST-284),占90%(27/30),其他3株菌序列型分别为 ST-367、ST-125、ST-296。8个管家基因核苷酸多态性(Pi)范围为0.00119(polB)~0.00648(uidA),putP基因多态性位点比例最高(4.6%),trpA基因多态性位点比例最低(0.4%)。进化分析结果显示,这些序列型分别属于Group 1及Group 11群。结论 浙江省动物源性大肠杆菌O157∶H7的主要序列型为ST-284,与江苏省病人株882364(ST-296)具有同一个进化祖先,提示应加强浙江省大肠杆菌O157病原学监测。

大肠杆菌O157;多位点序列分型(MLST);管家基因;分子流行病学

自大肠埃希菌O157被认识以来,对其基因的研究越来越细,目前已探明了许多结构与功能基因,并发现存在许多变异株,在其病因学、病理学及临床治疗方面均有长足的进展。随着细菌食源性疾病爆发的日益频繁以及多重耐药菌株的不断涌现,细菌形态、血清型和噬菌体型等传统分型方法已不能满足疫情分析及流行病学研究需要。常用的PFGE一般用于传染病爆发调查,而无法对菌株的遗传进化特征进行分析;MLST法则适宜于菌株的进化关系及微生物群体遗传学分析,一般用于广义的流行病学研究[1-2]。……

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